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Enregistrement W4386791193 · doi:10.1101/2023.09.11.557127

Discovery of a functionally selective serotonin 5-HT <sub>1A</sub> receptor agonist for the treatment of pain

2023· preprint· en· W4386791193 sur OpenAlexfundno aff
Annika Ullrich, Johannes Schneider, João M. Bráz, Eduard Neu, Nico Staffen, Markus Stanek, Jana Bláhová, Tamsanqa Hove, Tamara Albert, Anni Allikalt, Stefan Löber, Karnika Bhardwaj, Sian Rodriguez-Rosado, Elissa A. Fink, Tim Rasmussen, Harald Hübner, Asuka Inoue, Brian K. Shoichet, Allan J. Basbaum, Bettina Böttcher, Dorothée Weikert, Peter Gmeiner

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueReceptor Mechanisms and Signaling
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesJulius-Maximilians-Universität WürzburgDeutsche ForschungsgemeinschaftUniversité de MontréalStudienstiftung des Deutschen VolkesBoehringer Ingelheim StiftungEuropean CommissionJapan Society for the Promotion of ScienceVerband der Chemischen Industrie
Mots-clésAgonistG protein-coupled receptorSerotonin5-HT receptorFunctional selectivityChemistryReceptorPharmacologyPartial agonistNeuroscienceMedicineBiologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The G protein-coupled serotonin receptor 5-HT 1A R mediates antinociception and may serve as a valuable target for the treatment of pain. Starting from a chemical library, ST171, a bitopic chemotype activating 5-HT 1A R was evolved. In vitro pharmacological investigations of ST171 revealed potent and selective G i activation (EC 50 = 0.3 nM), with marginal G s and β-arrestin recruitment. Preclinical studies in mice showed that ST171 was effective in acute and chronic (inflammatory and neuropathic) pain models, without causing sedation. Comparison of cryo-EM structures of a 5-HT 1A R-G i complex bound to the functionally biased agonist ST171, with a structure bound to the functionally balanced agonist befiradol, showed that both ligands bind to the same orthosteric site, but address different exo-sites. The individual poses are associated with ligand-specific helical dispositions and rearrangements of microdomains. Complementation of these studies with molecular dynamics simulations allowed us to derive structural features associated with ST171’s functional selectivity, a phenomenon that may be crucial to the discovery of more effective and safe GPCR drugs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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