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Enregistrement W4386807697 · doi:10.1101/2023.09.15.557737

Transcriptomic signatures of Aβ- and tau-induced neuronal dysfunction reveal inflammatory processes at the core of Alzheimer’s disease pathophysiology

2023· preprint· en· W4386807697 sur OpenAlexafffund
Lazaro M. Sanchez-Rodriguez, Ahmed Faraz Khan, Quadri Adewale, Gleb Bezgin, Joseph Therriault, Jaime Fernandez‐Arias, Stijn Servaes, Nesrine Rahmouni, Cécile Tissot, Jenna Stevenson, Hongxiu Jiang, Xiaoqian J. Chai, Félix Carbonell, Pedro Rosa‐Neto, Yasser Iturria‐Medina

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeuroinflammation and Neurodegeneration Mechanisms
Établissements canadiensDouglas Mental Health University InstituteMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchFondation Brain Canada
Mots-clésNeuroscienceTranscriptomeDiseaseMicrogliaNeuroinflammationPathophysiologyPathogenesisImmune systemPathologicalBiologyMedicineInflammationBioinformaticsGeneImmunologyPathologyGene expressionGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Molecular mechanisms enabling pathology-induced neuronal dysfunction in Alzheimer’s disease (AD) remain elusive. Here, we use mechanistic computational models to infer the combined influence of PET-measured Aβ and tau burdens on fMRI-derived neuronal activity and to subsequently identify the transcriptomic spatial correlates of AD pathophysiology. Our results reveal overrepresented genes and biological processes that participate in synaptic degeneration and interact with Aβ and tau deposits. Furthermore, we confirmed the central role of the immune system and neuroinflammatory pathways within AD pathogenesis; microglia were significantly enriched in the gene set associated with Aβ and tau synergistic influences on neuronal activity. Lastly, our computational approach unveiled drug candidates with the potential to halt or reduce the observed pathological effects on neuronal activity, including existing medication for cancer, immune disorders, and cardiovascular diseases, many currently under clinical evaluation in AD. Overall, these findings support the notion that the AD brain experiences functional changes intricately associated with a diverse spectrum of molecular processes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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