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Enregistrement W4386874780 · doi:10.3138/jammi-2022-0038

Population-based study of <i>Morganella-Proteus-Providencia</i> group bloodstream infections

2023· article· en· W4386874780 sur OpenAlexaffvenueabout
Kevin B. Laupland, Kelsey Pasquill, Lisa Steele, Elizabeth C. Parfitt

Notice bibliographique

RevueJournal of the Association of Medical Microbiology and Infectious Disease Canada · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Identification and Susceptibility Testing
Établissements canadiensRoyal Inland Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésProvidenciaMorganella morganiiProteus mirabilisIncidence (geometry)PopulationMedicineEpidemiologyInternal medicineDemographyProteusPediatricsBiologyPseudomonas aeruginosaEnvironmental healthEnterobacteriaceaeGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: There is a paucity of studies investigating the population-based epidemiology of Morganella-Proteus-Providencia (MPP) group infections. Our objective was to determine the incidence, risk factors, and outcome of MPP group bloodstream infections (BSI), and explore species-specific differences. Methods: Population-based surveillance was conducted in the western interior of British Columbia, Canada, between April 1, 2010 and March 30, 2020. Results: Sixty-two incident MPP group BSI occurred for an annual incidence of 3.4 per 100,000 residents; rates for Morganella morganii, Proteus mirabilis, and Providencia species were 0.5, 2.6, and 0.3 per 100,000 population, respectively. The median year of age was 72.5 and was different ( p = 0.03) among the groups. Most (92%) MPP group BSIs were of community-onset. Significant differences were observed in the distribution of clinical focus of infection, with most notably 81% of P. mirabilis BSI due to genitourinary focus as compared to 60% and 22% for Providencia species and M. morganii, respectively. Comorbid illnesses that increased the risk for development of MPP group BSI (incidence rate ratio; 95% CI) were HIV infection (37.0; 4.4–139.6), dementia (11.5; 6.1–20.7), cancer (6.4; 3.2–11.9), stroke 6.5 (2.8–13.3), and diabetes 2.7 (1.3–5.0). Thirteen, one, and none of the cases with P. mirabilis, M. morganii, and Providencia species BSI died within 30 days of index culture for respective all cause case-fatalities of 27%, 11%, and 0% ( p = 0.1). Conclusions: Although collectively responsible for a substantial burden of illness, the epidemiology of MPP group BSI varies significantly by species.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,159
Score d'incertitude au seuil0,977

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,225
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2023
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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