Sensibilité de Neisseria gonorrhoeae aux antimicrobiens au Canada, 2021
Notice bibliographique
Résumé
Contexte : Au Canada, la gonorrhée est la deuxième infection bactérienne sexuellement transmissible la plus répandue.Le Programme de surveillance de la résistance des gonocoques aux antimicrobiens (GASP -Canada), un système de surveillance passive qui surveille la résistance aux antimicrobiens chez Neisseria gonorrhoeae au Canada depuis 1985, est la source de ce résumé des données démographiques, de la résistance aux antimicrobiens et du typage des séquences multiantigènes de N. gonorrhoeae (NG-MAST) des isolats gonococciques collectés au Canada en 2021.Méthodes : Les laboratoires de santé publique provinciaux et territoriaux ont soumis des cultures de N. gonorrhoeae et des données au Laboratoire national de microbiologie de Winnipeg dans le cadre du système de surveillance.La résistance aux antimicrobiens et le type moléculaire de chaque isolat reçu ont été déterminés.Résultats : Au total, 3 439 cultures de N. gonorrhoeae ont été reçues des laboratoires du pays en 2021, soit une augmentation de 9,9 % depuis 2020 (n = 3 130).La diminution de la sensibilité au céfixime a augmenté de manière significative (p < 0,001) en 2021 (1,5 %) par rapport à 2017 (0,6 %).Aucun changement significatif dans la diminution de la sensibilité à la ceftriaxone n'a été détecté entre 2017 et 2021 (0,6 %) (p > 0,001); cependant, un isolat résistant à la ceftriaxone a été identifié.La résistance à l'azithromycine a diminué de manière significative (p < 0,001) en 2021 (7,6 %) par rapport à 2017 (11,7 %); toutefois, on a observé une augmentation significative (p < 0,001) de la proportion de cultures présentant une concentration minimale inhibitrice d'azithromycine d'au moins 1 mg/L (2017 = 22,2 % à 2021 = 28,1 %).En 2021, NG-MAST-19875 (15,3 %) était le type de séquence le plus répandu au Canada; 20,3 % des isolats présentant ce type de séquence étaient résistants à l'azithromycine.Conclusion : La propagation de la gonorrhée résistante aux antimicrobiens est un problème de santé publique important.La poursuite de la surveillance régionale et nationale de la résistance aux antimicrobiens chez N. gonorrhoeae est essentielle pour garantir que des traitements efficaces sont recommandés.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,005 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».