Sensibilité de Neisseria gonorrhoeae aux antimicrobiens au Canada, 2021
Bibliographic record
Abstract
Contexte : Au Canada, la gonorrhée est la deuxième infection bactérienne sexuellement transmissible la plus répandue.Le Programme de surveillance de la résistance des gonocoques aux antimicrobiens (GASP -Canada), un système de surveillance passive qui surveille la résistance aux antimicrobiens chez Neisseria gonorrhoeae au Canada depuis 1985, est la source de ce résumé des données démographiques, de la résistance aux antimicrobiens et du typage des séquences multiantigènes de N. gonorrhoeae (NG-MAST) des isolats gonococciques collectés au Canada en 2021.Méthodes : Les laboratoires de santé publique provinciaux et territoriaux ont soumis des cultures de N. gonorrhoeae et des données au Laboratoire national de microbiologie de Winnipeg dans le cadre du système de surveillance.La résistance aux antimicrobiens et le type moléculaire de chaque isolat reçu ont été déterminés.Résultats : Au total, 3 439 cultures de N. gonorrhoeae ont été reçues des laboratoires du pays en 2021, soit une augmentation de 9,9 % depuis 2020 (n = 3 130).La diminution de la sensibilité au céfixime a augmenté de manière significative (p < 0,001) en 2021 (1,5 %) par rapport à 2017 (0,6 %).Aucun changement significatif dans la diminution de la sensibilité à la ceftriaxone n'a été détecté entre 2017 et 2021 (0,6 %) (p > 0,001); cependant, un isolat résistant à la ceftriaxone a été identifié.La résistance à l'azithromycine a diminué de manière significative (p < 0,001) en 2021 (7,6 %) par rapport à 2017 (11,7 %); toutefois, on a observé une augmentation significative (p < 0,001) de la proportion de cultures présentant une concentration minimale inhibitrice d'azithromycine d'au moins 1 mg/L (2017 = 22,2 % à 2021 = 28,1 %).En 2021, NG-MAST-19875 (15,3 %) était le type de séquence le plus répandu au Canada; 20,3 % des isolats présentant ce type de séquence étaient résistants à l'azithromycine.Conclusion : La propagation de la gonorrhée résistante aux antimicrobiens est un problème de santé publique important.La poursuite de la surveillance régionale et nationale de la résistance aux antimicrobiens chez N. gonorrhoeae est essentielle pour garantir que des traitements efficaces sont recommandés.
Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.
How this classification was reachedexpand
Full frame machine prediction
Teacher imitationNot calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.
Distilled classifier scores by category (both heads)
| Category | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Metaresearch | 0.001 | 0.005 |
| Meta-epidemiology (narrow) | 0.000 | 0.000 |
| Meta-epidemiology (broad) | 0.000 | 0.000 |
| Bibliometrics | 0.001 | 0.002 |
| Science and technology studies | 0.001 | 0.001 |
| Scholarly communication | 0.001 | 0.000 |
| Open science | 0.001 | 0.001 |
| Research integrity | 0.001 | 0.001 |
| Insufficient payload (model declined to judge) | 0.003 | 0.000 |
Machine scores (provisional)
The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.
Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.
score_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from itClassification
machine, unvalidatedMachine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.
How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".