The causality between telomere length and chronic lung diseases: A Bidirectional Mendelian Randomization Analysis
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Previous studies have observed the abnormality in telomere biology and function during the process of chronic lung diseases (CLDs). However, whether alteration of telomere length (TL) causally facilitates the incidence of CLDs remains to be determined. Therefore, we here aim to estimate the causal effect of TL on the risk of CLDs using mendelian randomization (MR) analysis. Methods Single nucleotide polymorphisms (SNPs) strongly associated with TL and CLDs were selected as genetic variables from the genome-wide association studies (GWAS). A bidirectional two-sample MR analysis primarily based on inverse variance weighted (IVW) method was then conducted to infer the causality between TL and CLDs. Cochran’s Q test and MR-Egger regression analysis were performed to assess the heterogeneity and pleiotropy, and leave-one-out analysis was tested to determine the stability of MR results. Results The forward MR analysis indicated that among non-neoplastic CLDs, elevated TL was causally related to reduced risk of asthma (OR = 0.9986, 95%CI 0.9972–0.9999, P = 0.035), chronic obstructive pulmonary disease (COPD) (OR = 0.9987, 95%CI 0.9975–0.9999, P = 0.040), idiopathic pulmonary fibrosis (IPF) (OR = 0.9971, 95%CI 0.9961–0.9980, P < 0.001), and sarcoidosis (OR = 0.6820, 95%CI 0.5236–0.8884, P = 0.005). For neoplastic CLDs, increased TL genetically predicted higher risk of non-small cell lung cancer (OR = 1.8485, 95%CI 1.4074–2.4279, P < 0.001) and lung adenocarcinoma (OR = 1.9636, 95%CI 1.2275–3.1412, P = 0.005). However, there presented no significant causality between TL and pulmonary arterial hypertension, pneumoconiosis, small cell lung cancer and squamous cell lung cancer. Moreover, reverse MR analysis all showed no obvious causalities of CLDs with TL, except for sarcoidosis (OR = 0.9936, 95%CI 0.9887–0.9984, P = 0.010). Sensitivity analyses suggested the robustness of MR results with no horizonal pleiotropy despite of partial heterogeneity in reverse MR analysis. Conclusions Our study demonstrates that TL is causally associated with decreased risk of several non-neoplastic CLDs (asthma, COPD and IPF), whereas associated with increased risk of non-small cell lung cancer (especially adenocarcinoma). There’s mutual causality between TL attrition and sarcoidosis onset. This study comprehensively elucidated the causal associations between TL and CLDs, and might provide a promising target for the prevention of these CLDs.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,049 | 0,072 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,003 | 0,007 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,008 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».