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Enregistrement W4387114306 · doi:10.1128/msphere.00162-23

Vaborbactam increases meropenem susceptibility in <i>Pseudomonas aeruginosa</i> clinical isolates displaying MexXY and AmpC upregulation

2023· article· en· W4387114306 sur OpenAlex
Mariana Castanheira, Timothy B Doyle, Cory Hubler, Sean DeVries, Dee Shortridge

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevuemSphere · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMedical Center, University of RochesterNational Institutes of HealthIdorsia PharmaceuticalsWockhardtTenNor TherapeuticsAstellas Foundation for Research on Metabolic DisordersBasilea PharmaceuticaAstellas PharmaNorth Bristol NHS TrustShionogiMeiji Seika PharmaUniversity of QueenslandPfizerMelinta TherapeuticsEntasis TherapeuticsAlbany College of Pharmacy and Health SciencesAchaogenAmplyxRoivant SciencesNational University of SingaporeNabriva TherapeuticsGenePOCUniversity of Texas Southwestern Medical CenterMedicines CompanyUniversity of North TexasNovartisHarvard UniversityF. Hoffmann-La RocheWayne State UniversityMedpaceGlaxoSmithKlineAllerganCidara TherapeuticsUniversity of Southern CaliforniaTufts Medical CenterBayerBeth Israel Deaconess Medical Center
Mots-clésPseudomonas aeruginosaMeropenemMicrobiologyBiologyPseudomonadaceaeGeneAntibioticsBacteriaAntibiotic resistanceGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT To evaluate the resistance mechanisms among Pseudomonas aeruginosa clinical isolates exhibiting meropenem (MEM) MIC values higher than meropenem-vaborbactam (MEV). P. aeruginosa clinical isolates collected in US hospitals from 2014 to 2019 were susceptibility tested. Whole-genome and transcriptome sequencing were performed. Results were analyzed for strain typing, acquired β-lactamases, and mutations in chromosomal genes; gene expression was measured for known β-lactam resistance contributors. Results were compared to a control group of 10 P . aeruginosa isolates displaying MIC values at 8 mg/L for meropenem ± vaborbactam (MEM = MEV). Out of 88 isolates displaying MEM &gt; MEV, 33 (37.5%) isolates had reproducibly lower MIC values for meropenem-vaborbactam compared to meropenem when retested. The expression of mexX , mexY , mexZ , and ampC was significantly greater among a higher percentage of the MEM &gt; MEV isolates. Furthermore, the association of mexXY and ampC overexpression was detected in 17/33 MEM &gt; MEV isolates and only 1/10 MEM = MEV isolate. In addition, the Pseudomonas -derived cephalosporinase amino acid substitution R79Q was detected among 33.3% of the isolates displaying MEM &gt; MEV, and none of the isolates displayed MEM = MEV. Other resistance mechanisms were not observed or were equally observed in both groups. In rare cases, vaborbactam plays a role in lowering the meropenem MIC values in P. aeruginosa clinical isolates likely due to the inhibition of the AmpC gene that was overexpressed in the presence of upregulation of MexXY with or without alterations in the AmpC gene. IMPORTANCE Pseudomonas aeruginosa isolates are intrinsically resistant to multiple antimicrobial agents and meropenem is an important therapeutic option to treat infections caused by this organism. Meropenem-vaborbactam activity is similar to that of meropenem alone against P. aeruginosa isolates. Isolates belonging to this species that display lower meropenem-vaborbactam compared to meropenem are rare. We initiated this study to understand the resistance mechanisms that could lead to lower meropenem-vaborbactam MIC values when compared to meropenem alone. We documented that isolates displaying lower meropenem-vaborbactam exhibited overexpression of MexXY and AmpC. In addition, isolates displaying the R79Q PDC (AmpC) mutation were more likely to display lower meropenem-vaborbactam when compared to isolates displaying the same MIC values for these agents.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,135
Score d'incertitude au seuil0,678

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,299
Écart entre enseignants0,281 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle