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Enregistrement W4387244229 · doi:10.1101/2023.10.01.560360

Inferring plasticity rules from single-neuron spike trains using deep learning methods

2023· preprint· en· W4387244229 sur OpenAlexaff
Xingyun Wang, Jean-Claude Béı̈que, Richard Naud

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueAdvanced Memory and Neural Computing
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésComputer scienceArtificial intelligenceLearning ruleClassifier (UML)Machine learningConvolutional neural networkSynaptic plasticitySpike-timing-dependent plasticityTransformerDeep learningArtificial neural networkPattern recognition (psychology)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Synaptic plasticity is a core basis for learning and adaptation. Determining how synapses are altered by local signals – the learning rules – is the hinge about which brain activity pivots. A large number of in vitro characterizations have focused on restricted sets of core properties, but it remains to be established which if any of the known learning rules is most consistent with changes in activity patterns in behaving animals. To address this question, we hypothesize that the correlation between features of the activity of a single post-synaptic neuron and subsequent changes of the representations could be used to detect the underlying learning rule. Because this correlation is expected to be diluted in the notoriously large variability of brain activity, we test here learning rule inference based on passive observations of single neurons using deep artificial neural networks. Using simulated data, we found that both transformers, temporal convolutional networks, and SVM could classify learning rules far above the chance level, with transformers achieving the best overall accuracy. This performance can be achieved despite the presence of noise and representational drift. We further investigated the features used by the algorithms to perform the classification and found the deep net used inner temporal differences of distinct learning rules to separate learning trajectories. We also find, however, that the classification accuracy is sensitive to alterations in network properties. Our work illustrates that distinct learning rules’ generate distinguishable trajectories of responses, but warns against using simulation-trained classifiers to infer learning rules from real data.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,053
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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