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Enregistrement W4387298120 · doi:10.1101/2023.10.01.23296379

Mapping the aetiological foundations of the heart failure spectrum using human genetics

2023· preprint· en· W4387298120 sur OpenAlexaff
Albert Henry, Xiaodong Mo, Chris Finan, Mark Chaffin, Doug Speed, Hanane Issa, Spiros Denaxas, James S. Ware, Sean L. Zheng, Anders Mälarstig, Jasmine Gratton, Isabelle Bond, Carolina Roselli, D.J. Miller, Sandesh Chopade, Amand F. Schmidt, Erik Abner, Lance Adams, Charlotte Andersson, Krishna G. Aragam, Johan Ärnlöv, Géraldine Asselin, Anna Axelsson Raja, Joshua Backman, Traci M. Bartz, Kiran J. Biddinger, Mary L. Biggs, Heather L. Bloom, Eric Boersma, Jeffrey Brandimarto, Michael R. Brown, Søren Brunak, Mie Topholm Bruun, Leonard Buckbinder, Henning Bundgaard, David J. Carey, Daniel I. Chasman, Xing Chen, James P. Cook, Tomasz Czuba, Simon de Denus, Abbas Dehghan, Graciela E. Delgado, Alex S. F. Doney, Marcus Dörr, Joseph Dowsett, Samuel C. Dudley, Gunnar Engström, Christian Erikstrup, Tõnu Esko, Eric Farber‐Eger, Stephan B. Felix, Sarah Finer, Ian Ford, Mohsen Ghanbari, Sahar Ghasemi, Jonas Ghouse, Vilmantas Giedraitis, Franco Giulianini, John S. Gottdiener, Stefan Groß, Daníel F. Guðbjartsson, Hongsheng Gui, Rebecca Gutmann, Sara Hägg, Christopher M. Haggerty, Åsa K. Hedman, Anna Helgadóttir, Harry Hemingway, Hans L. Hillege, Craig Hyde, Bitten Aagaard, J. Wouter Jukema, Isabella Kardys, Ravi Karra, Maryam Kavousi, Jorge R. Kizer, Marcus E. Kleber, Lars Køber, Andrea Koekemoer, Karoline Kuchenbaecker, Yi-Pin Lai, David E. Lanfear, Claudia Langenberg, Honghuang Lin, Lars Lind, Cecilia M. Lindgren, Peter P. Liu, Barry London, Brandon D. Lowery, Jian’an Luan, Steven A. Lubitz, Patrik K. E. Magnusson, Kenneth B. Margulies, Nicholas Marston, Hilary C. Martin, Winfried März, Olle Melander, Ify Mordi, Michael P. Morley, Andrew P. Morris, Alanna C. Morrison, Lori Morton, Michael W. Nagle, Christopher P. Nelson, Alexander Niessner, Teemu Niiranen, Raymond Noordam, Christoph Nowak, Michelle L. O’Donoghue, Sisse Rye Ostrowski, Anjali Owens, Guillaume Paré, Ole Birger Pedersen, Markus Perola, Marie Pigeyre, Bruce M. Psaty, Kenneth Rice, Paul M. Ridker, Simon P.R. Romaine, Jerome I. Rotter, Christian T. Ruff, Mark S. Sabatine, Neneh Sallah, Veikko Salomaa, Naveed Sattar, Alaa Shalaby, Akshay Shekhar, Diane T. Smelser, Nicholas L. Smith, Erik Sørensen, Sundararajan Srinivasan, Kāri Stefánsson, Garðar Sveinbjörnsson, Per Svensson, Mari‐Liis Tammesoo, Jean‐Claude Tardif, Maris Teder‐Laving, Alexander Teumer, Guðmundur Þorgeirsson, Unnur Þorsteinsdóttir, Christian Torp‐Pedersen, Vinicius Tragante, Stella Trompet, André G. Uitterlinden, Henrik Ullum, Pim van der Harst, David A. van Heel, Jessica van Setten, Marion van Vugt, Abirami Veluchamy, Monique Verschuuren, Niek Verweij, Christoffer Rasmus Vissing, Uwe Völker, Adriaan A. Voors, Lars Wallentin, Yunzhang Wang, Peter Weeke, Kerri L. Wiggins, L. Keoki Williams, Yifan Yang, Bing Yu, Faı̈ez Zannad, Chaoqun Zheng, Folkert W. Asselbergs, Thomas P. Cappola, Marie‐Pierre Dubé, Michael E. Dunn, Chim C. Lang, Nilesh J. Samani, Svati H. Shah, Ramachandran S. Vasan, J. G. Smith, Hilma Hólm, Sonia Shah, Patrick T. Ellinor, Aroon D. Hingorani, Quinn S. Wells, R Thomas Lumbers

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensMcMaster UniversityUniversity of OttawaThrombosis and Atherosclerosis Research InstitutePopulation Health Research InstituteUniversité de MontréalMontreal Heart Institute
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilBritish Heart Foundation
Mots-clésHeart failure with preserved ejection fractionHeart failureEjection fractionGenome-wide association studyConfoundingEtiologyDiseasePopulationProteostasisBiologyBioinformaticsMedicineGeneticsInternal medicineSingle-nucleotide polymorphismGeneGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Summary paragraph Heart failure (HF), a syndrome of symptomatic fluid overload due to cardiac dysfunction, is the most rapidly growing cardiovascular disorder. Despite recent advances, mortality and morbidity remain high and treatment innovation is challenged by limited understanding of aetiology in relation to disease subtypes. Here we harness the de-confounding properties of genetic variation to map causal biology underlying the HF phenotypic spectrum, to inform the development of more effective treatments. We report a genetic association analysis in 1.9 million ancestrally diverse individuals, including 153,174 cases of HF; 44,012 of non-ischaemic HF; 5,406 cases of non-ischaemic HF with reduced ejection fraction (HFrEF); and 3,841 cases of non-ischaemic HF with preserved ejection fraction (HFpEF). We identify 66 genetic susceptibility loci across HF subtypes, 37 of which have not previously been reported. We map the aetiologic contribution of risk factor traits and diseases as well as newly identified effector genes for HF, demonstrating differential risk factor effects on disease subtypes. Our findings highlight the importance of extra-cardiac tissues in HF, particularly the kidney and the vasculature in HFpEF. Pathways of cellular senescence and proteostasis are notably uncovered, including IGFBP7 as an effector gene for HFpEF. Using population approaches causally anchored in human genetics, we provide fundamental new insights into the aetiology of heart failure subtypes that may inform new approaches to prevention and treatment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,089
Tête enseignante GPT0,324
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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