MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4387298459 · doi:10.1093/ofid/ofad496

Genomic Analysis of Group B <i>Streptococcus</i> Carriage Isolates From Botswana Reveals Distinct Local Epidemiology and Identifies Novel Strains

2023· article· en· W4387298459 sur OpenAlexfundno aff
Karen L Hanze Villavicencio, Megan Job, Anne Claire Burghard, Allison Taffet, Francis Msume Banda, Moses Vurayai, Margaret Mokomane, Tonya Arscott‐Mills, Tiny Mazhani, Seeletso Nchingane, Brady Thomas, Andrew P. Steenhoff, Adam J. Ratner

Notice bibliographique

RevueOpen Forum Infectious Diseases · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeonatal and Maternal Infections
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesCenter for AIDS Research, University of WashingtonYork UniversityUniversity of PennsylvaniaNational Institutes of HealthNYU Grossman School of MedicineChildren's Hospital of PhiladelphiaPediatric Infectious Diseases Society
Mots-clésCarriageGroup BStreptococcusStreptococcus agalactiaeEpidemiologyMedicineMolecular epidemiologyErythromycinMicrobiologyGroup ASequence (biology)BiologyGeneticsGenotypeAntibioticsGeneBacteriaInternal medicinePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract In pregnant people colonized with group B Streptococcus (GBS) in Botswana, we report the presence/expansion of sequence types 223 and 109, a low rate of erythromycin resistance, and 3 novel sequence types. These data highlight the importance of local epidemiologic studies of GBS, a significant source of neonatal disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,996

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,316
Écart entre enseignants0,289 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueOpen Forum Infectious DiseasesMême sujetNeonatal and Maternal InfectionsTravaux en français237 207