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Enregistrement W4387326961 · doi:10.1128/mbio.01807-23

The Adr1 transcription factor directs regulation of the ergosterol pathway and azole resistance in <i>Candida albicans</i>

2023· article· en· W4387326961 sur OpenAlexafffund
Manjari Shrivastava, Gaëlle S. Kouyoumdjian, Eftyhios Kirbizakis, Daniel Ruiz, Manon Henry, Antony T. Vincent, Adnane Sellam, Malcolm Whiteway

Notice bibliographique

RevuemBio · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntifungal resistance and susceptibility
Établissements canadiensUniversité de MontréalConcordia UniversityUniversité LavalMontreal Heart Institute
Organismes subventionnairesFonds de recherche du QuébecConcordia UniversityNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaGovernment of Canada
Mots-clésCandida albicansTranscription factorErgosterolCorpus albicansBiologyZinc finger transcription factorBiochemistrySaccharomyces cerevisiaeGeneZinc fingerMicrobiologyCell biologyChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Transcription factors (TFs) play key roles in cellular regulation and are critical in the control of drug resistance in the fungal pathogen Candida albicans . We found that activation of the transcription factor C4_02500C_A (Adr1) conferred significant resistance against fluconazole. In Saccharomyces cerevisiae , Adr1 is a carbon-source-responsive zinc-finger transcription factor required for transcription of the glucose-repressed gene ADH1 and of genes required for ethanol, glycerol, and fatty acid utilization. Motif scanning of promoter elements suggests that Adr1 may be rewired in fungi and govern the ergosterol synthesis pathway in C. albicans . Because previous studies have identified the zinc-cluster transcription factor Upc2 as a regulator of the ergosterol pathway in both fungi, we examined the relationship between Adr1 and Upc2 in sterol biosynthesis in C. albicans . Phenotypic profiles of either ADR1 or UPC2 modulation in C. albicans showed differential growth in the presence of fluconazole; either adr1 or upc2 homozygous deletion results in sensitivity to the drug, while their activation generates a fluconazole-resistant strain. The rewiring from ergosterol synthesis to fatty acid metabolism involved all members of the Adr1 regulon except the alcohol dehydrogenase Adh1, which remains under Adr1 control in both circuits and may have been driven by the lifestyle of S . cerevisiae , which requires the ability to both tolerate and process high concentrations of ethanol. Importance Research often relies on well-studied orthologs within related species, with researchers using a well-studied gene or protein to allow prediction of the function of the ortholog. In the opportunistic pathogen Candida albicans , orthologs are usually compared with Saccharomyces cerevisiae , and this approach has been very fruitful. Many transcription factors (TFs) do similar jobs in the two species, but many do not, and typically changes in function are driven not by modifications in the structures of the TFs themselves but in the connections between the transcription factors and their regulated genes. This strategy of changing TF function has been termed transcription factor rewiring. In this study, we specifically looked for rewired transcription factors, or Candida -specific TFs, that might play a role in drug resistance. We investigated 30 transcription factors that were potentially rewired or were specific to the Candida clade. We found that the Adr1 transcription factor conferred resistance to drugs like fluconazole, amphotericin B, and terbinafine when activated. Adr1 is known for fatty acid and glycerol utilization in Saccharomyces , but our study reveals that it has been rewired and is connected to ergosterol biosynthesis in Candida albicans .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,520
Score d'incertitude au seuil0,346

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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