Aphanomyces astaci in Mexico: A new haplotype from dwarf crayfish Cambarellus montezumae
Notice bibliographique
Résumé
The crayfish plague is an emerging infectious disease caused by the pathogen Aphanomyces astaci (Oomycota), which is responsible for the decimation of Eurasian freshwater crayfish. This pathogen can coexist with the North American crayfish. These are chronic carriers of the disease as consequence of an immune response that can contain the growth of the pathogen without killing it. The origin of A. astaci locates in the southeastern United States and coincides with the origin of the family Cambaridae. This diverse family of decapods is distributed in North America from southern Canada to Honduras. However, only the native crayfish species from Canada and the USA have been examined for the presence of A. astaci. In this study, we describe for the first time the presence of A. astaci in Mexico in a population of the native species Cambarellus montezumae. By analyzing the small (rrnS) and large (rrnL) mitochondrial ribosomal regions, we showed the presence of two haplotypes of A. astaci within the same population (d1-haplotype and, a novel haplotype that was named, mex1-haplotype). The finding of A. astaci in Mexico confirms the occurrence of this pathogen within the range of the family Cambaridae. The individuals of C. montezumae appear to be chronic carriers of A. astaci, indicated by the lack of documented crayfish plague outbreaks in this population, similar to the pattern observed in other North American species. Thus, the results are of special concern to susceptible species of southern regions of America, i.e., Parastacidae. Therefore, this work emphasizes the need to better understand the distribution and genetic diversity of A. astaci within the distribution range of the natural carriers, i.e., North American species, especially the unexplored area of the family Cambaridae.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».