TargeTron inactivation of plasmid-regulated <i>Chlamydia trachomatis</i> CT084 results in a nonlytic phenotype
Notice bibliographique
Résumé
Chlamydia trachomatis is an obligate intracellular bacterium that causes blinding trachoma and sexually transmitted disease. The chlamydial plasmid is a critical virulence factor in the pathogenesis of these diseases. Plasmid gene protein 4 (Pgp4) plays a major role in chlamydial virulence by regulating the expression of both chromosomal genes and Pgp3. Despite the importance of Pgp4 in mediating lytic exit from host cells the pathogenic mechanism by which it functions is unknown. CT084 is a highly conserved chromosomal gene with homology to phospholipase D. We showed CT084 expression is regulated by Pgp4 and expressed late in the chlamydial developmental cycle. To investigate the function of CT084 in chlamydial lytic exit from infected cells, we made a CT084 null strain (ct084::bla) by using Targetron. The ct084::bla strain grew normally in vitro compared to wild-type strain; however, the strain did not lyse infected cells and produced significantly less and smaller plaques. Collectively, our finding shows Pgp4-regulated CT084-mediated chlamydia lytic exit from infected host cells.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».