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Enregistrement W4387460446 · doi:10.1101/2023.10.05.561142

Retinoic Acid Boosts HIV-1 Replication in Macrophages <i>via</i> CCR5/SAMHD1-Dependent and mTOR-Modulated Mechanisms

2023· preprint· en· W4387460446 sur OpenAlexafffund
Jonathan Dias, Amélie Cattin, Jean-Philippe Goulet, Augustine Fert, Laurence Raymond Marchand, Tomas Raul Wiche Salinas, Christ-Dominique Ngassaki Yoka, Etiene Moreira Gabriel, Edwin Ramon Caballero, Jean‐Pierre Routy, Petronela Ancuța

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensMcGill University Health CentreCaprion (Canada)Université de MontréalCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesMcGill University Health CentreCanadian Institutes of Health ResearchCanadian Foundation for AIDS ResearchMcGill UniversityFondation du CHUM
Mots-clésSAMHD1Retinoic acidBiologyPI3K/AKT/mTOR pathwayViral replicationDownregulation and upregulationViral loadImmunologyVirologyCell biologyHuman immunodeficiency virus (HIV)GeneGeneticsRNASignal transductionReverse transcriptaseVirus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT The intestinal environment facilitates HIV-1 infection via mechanisms involving the gut-homing elixir retinoic acid (RA), which transcriptionally reprograms CD4 + T-cells for increased HIV-1 permissiveness. Consistently, colon-infiltrating CD4 + T-cells carry replication-competent viral reservoirs in people living with HIV-1 (PLWH) receiving antiretroviral therapy (ART). Intriguingly, integrative infection in colon macrophages, a pool replenished by circulating monocytes, represents a rare event in ART-treated PLWH, thus questioning on HIV-1 permissiveness in gut-resident macrophages. Here, we demonstrate that RA significantly boosts R5 but not X4 HIV-1 replication in monocyte-derived macrophages (MDMs). RNA-Sequencing, Gene Set Variation Analysis, and HIV interactor NCBI database interrogation, revealed RA- mediated transcriptional reprogramming associated with metabolic/inflammatory processes and HIV-1 resistance/dependency factors. Functional validations pointed to mechanisms of RA action, including CCR5 upregulation and SAMHD1 phosphorylation under the control of mTOR. These results support a model in which intestinal MDM contribute to viral replication/dissemination before ART and upon treatment interruption in mTOR-sensitive manner. Figure 1:

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,031

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0090,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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