Abstract P312: Three-Month Human Endothelin-1 Endothelial Overexpression Up-Regulated <i>Khdrbs3</i> And Caused <i>Vegfa</i> And <i>Nrp2</i> Alternative Splicing In Mesenteric Arteries Of Male Mice
Notice bibliographique
Résumé
Background: Transgenic mice with tamoxifen-inducible endothelium-restricted human endothelin-1 overexpression (ieET-1) exhibited blood pressure (BP) elevation 3 weeks or 3 months after induction, and vascular injury was observed after 3 months. We hypothesized that 3-week or 3-month exposure to ET-1 overexpression leads to gene dysregulation in mesenteric arteries (MAs). Methods: Ten to 12-week old male ieET-1 mice and control ieCre mice expressing a tamoxifen-inducible Cre recombinase under the control of the endothelium-specific Tie2 promoter were treated with tamoxifen (1 mg/kg/day, s.c.) for 5 days and euthanized 16 days or 3 months later. RNA was extracted from MAs and used for total RNA-sequencing using Illumina HiSeq-2500. Differentially expressed (DE) genes were identified with fold change >1.3 and P <0.005. DE genes were validated by reverse transcription-quantitative PCR (RT-qPCR) using another set of mice. Alternative splicing was revealed by Spladder and validated by RT-qPCR in MAs. Results: RNA-sequencing revealed DE genes after 3-week (54) and 3-month ET-1 overexpression (7). Alternative splicing changes in mRNAs were revealed after 3-week (39) and 3-month ET-1 overexpression (21). One of the 3 genes validated by RT-qPCR, Khdrbs3, encodes KH domain containing RNA binding signal transduction associated 3 that regulates exon retention of some mRNAs including exon 7 of vascular endothelial growth factor A ( Vegfa ). Khdrbs3 was up-regulated after 3-week (fold change: 2.4±0.1 vs 1.0±0.1, P <0.05) and 3-month ET-1 overexpression (2.3±0.3 vs 1.3±0.1, P <0.05). Vegfa exon 7 retention was validated by demonstration of up-regulation of Vegfa 164 (1.3±0.1 vs 0.9±0.1, P<0.05) and Vegfa 188 isoforms (1.1±0.1 vs 0.9±0.1, P<0.05) after 3-month ET-1 overexpression ( P <0.05). Neuropilin 2 ( Nrp2 ) that interacts with VEGFA receptors was one of DE genes with alternative splicing in exon 17 ( Nrp2 a isoforms). Predicted Nrp2 a down-regulation ( P <0.05) was validated by RT-qPCR showing a decrease after 3-month ET overexpression (0.6±0.1 vs 1.1±0.2, P <0.05). Conclusions: This study demonstrated that 3-month ET-1 overexpression up-regulated Khdrbs3 and alternative splicing of Vegfa and Nrp2 , which may play a role in vascular injury in hypertension.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».