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Enregistrement W4387569702 · doi:10.1183/13993003.00925-2023

Long-term outcomes of the global tuberculosis and COVID-19 co-infection cohort

2023· article· en· W4387569702 sur OpenAlexfundno aff
Nicolás Casco, Alberto Levi Jorge, Domingo Palmero, Jan‐Willem C. Alffenaar, Greg J. Fox, Wafaa Ezz, Jin‐Gun Cho, Justin T. Denholm, Alena Skrahina, Varvara Solodovnikova, Marcos Abdo Arbex, Tatiana Alves, Marcelo Fouad Rabahi, Giovana Rodrigues Pereira, Roberta Sales, Denise Rossato Silva, Muntasir Saffie, Nadia Escobar Salinas, Ruth Caamaño Miranda, Catalina Cisterna, Clorinda Concha, Israel Fernandez, Claudia Villalón, Carolina Guajardo Vera, Patricia Gallegos Tapia, Viviana Cancino, Monica Carbonell, Arturo Jiménez Cruz, Eduardo Muñóz, Camila Muñoz, Indira Navarro, Rolando Pizarro, Gloria Pereira Cristina Sánchez, Maria Soledad Vergara Riquelme, Evelyn Vilca, Aline Soto, Ximena Figueroa Flores, Ana Garavagno, Martina Hartwig Bahamondes, L. Merino, Ana María Pradenas, Macarena Espinoza Revillot, Patricia Rodríguez, Angeles Serrano Salinas, Carolina Taiba, Joaquín Farías Valdés, Jorge Navarro Subiabre, Carlos Ortega, Sofia Palma, Patricia Perez Castillo, Mónica Pinto, Francisco Rivas Bidegain, Margarita Venegas, Edith Yucra, Yang Li, Andres Cruz, Beatriz Guelvez, Regina Victoria Plaza, Kelly Yoana Tello Hoyos, José Landivar, Martin van den Boom, Claire Andréjak, F.–X. Blanc, Samir Dourmane, Antoine Froissart, A. Izadifar, F. Rivière, F. Schlemmer, Κaterina Manika, Boubacar Diallo, Souleymane Hassane-Harouna, Norma Artiles, Licenciada Andrea Mejia, Nitesh Gupta, Pranav Ish, Gyanshankar Mishra, Jigneshkumar M. Patel, Rupak Singla, Zarir Udwadia, Francesca Alladio, Fabio Angeli, Andrea Calcagno, Rosella Centis, Luigi Ruffo Codecasa, Angelo De Lauretis, Susanna Esposito, Beatrice Formenti, Alberto Gaviraghi, Vania Giacomet, Delia Goletti, Gina Gualano, Alberto Matteelli, Giovanni Battista Migliori, Ilaria Motta, Fabrizio Palmieri, Emanuele Pontali, Tullio Prestileo, Niccolò Riccardi, Laura Saderi, Matteo Saporiti, Giovanni Sotgiu, Antonio Spanevello, Claudia Stochino, Marina Tadolini, Alessandro Torre, Simone Villa, Dina Visca, Xhevat Kurhasani, Mohammed Furjani, Najia Rasheed, Edvardas Danila, Saulius Diktanas, Ruy López‐Ridaura, Fátima Leticia Luna López, Marcela Muñoz Torrico, Adrián Rendón, Onno W. Akkerman, Seif Al-Abri, Fatma Alyaquobi, Khalsa Al-Thohli, Sarita Aguirre, Rosarito Coronel Teixeira, Viviana de Egea, Sandra Irala, Angélica Medina, Guillermo Sequera, Natalia Sosa, Fátima Vázquez, Félix Llanos-Tejada, Selene Manga, Renzo Villanueva-Villegas, David Araújo, Raquel DuarteTânia Sales Marques, Adriana Socaci, O.N. Barkanova, Maria Bogorodskaya, Sergey M. Borisov, Andrei Mariandyshev, Anna Kaluzhenina, Tatjana Adzić Vukicevic, Maja Stošić, Darius Beh, Deborah HL Ng, Ong C, Ivan Solovič, Keertan Dheda, Phindile Gina, José A. Caminero, María Luiza de Souza-Galvão, Ángel Domínguez-Castellano, José-María García-García, Israel Molina Pinargote, Sarai Quirós Fernandez, Adrián Sánchez‐Montalvá, Eva Tabernero Huguet, Miguel Zabaleta Murguiondo, Pierre‐Alexandre Bart, Jesica Mazza‐Stalder, Lia D’Ambrosio, Phalin Kamolwat, Freya Bakko, James Barnacle, Sophie Bird, Annabel Brown, Shruthi Chandran, Kieran Killington, Kathy Man, Padmasayee Papineni, Flora Ritchie, Simon Tiberi, Natasa Utjesanovic, Dominik Zenner, Jasie Hearn, Scott K. Heysell, Laura Young

Notice bibliographique

RevueEuropean Respiratory Journal · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTuberculosis Research and Epidemiology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of Infection and ImmunityNIH Clinical CenterFaculty of Medicine and Health, University of SydneyBarts and The London School of Medicine and DentistryUniversitat Autònoma de BarcelonaHuashan HospitalLondon School of Hygiene and Tropical MedicineUniversidade do PortoBarts Health NHS TrustFundació Institut de Recerca Hospital Universitari Vall d’HebronNational University Health SystemRadboud Universitair Medisch CentrumInstitute of Nuclear Energy ResearchSociété de Pneumologie de Langue FrançaiseMinisterio de Salud y Protección SocialUniversitair Medisch Centrum GroningenUniversité de LausanneInstitute for Health Innovation and Technology, National University of SingaporeMcMaster UniversityFudan UniversityUniversity of Cape TownCentre Hospitalier Universitaire VaudoisInstituto De Saúde Pública, Universidade do PortoInstituto de Salud Carlos IIINational University of SingaporeSociedad Española de Neumología y Cirugía TorácicaRadboud UniversiteitUniversity College LondonUniversity of SydneyUniversidad del CaucaUniversidade Federal do Rio Grande do SulRijksuniversiteit GroningenUniversidade Federal de GoiásVirginia Department of HealthI.M. Sechenov First Moscow State Medical UniversityQueen Mary University of LondonUniversidad de CuencaUniversidad Católica de Cuenca
Mots-clésMedicineHazard ratioTuberculosisProportional hazards modelCohortCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Internal medicineCohort studySurvival analysisRetrospective cohort studyMortality rateDiseaseConfidence intervalInfectious disease (medical specialty)Pathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Longitudinal cohort data of patients with tuberculosis (TB) and coronavirus disease 2019 (COVID-19) are lacking. In our global study, we describe long-term outcomes of patients affected by TB and COVID-19. METHODS: We collected data from 174 centres in 31 countries on all patients affected by COVID-19 and TB between 1 March 2020 and 30 September 2022. Patients were followed-up until cure, death or end of cohort time. All patients had TB and COVID-19; for analysis purposes, deaths were attributed to TB, COVID-19 or both. Survival analysis was performed using Cox proportional risk-regression models, and the log-rank test was used to compare survival and mortality attributed to TB, COVID-19 or both. RESULTS: those dying because of either TB or COVID-19 alone (p<0.001). Significant adjusted risk factors for TB mortality were higher age (hazard ratio (HR) 1.05, 95% CI 1.03-1.07), HIV infection (HR 2.29, 95% CI 1.02-5.16) and invasive ventilation (HR 4.28, 95% CI 2.34-7.83). For COVID-19 mortality, the adjusted risks were higher age (HR 1.03, 95% CI 1.02-1.04), male sex (HR 2.21, 95% CI 1.24-3.91), oxygen requirement (HR 7.93, 95% CI 3.44-18.26) and invasive ventilation (HR 2.19, 95% CI 1.36-3.53). CONCLUSIONS: In our global cohort, death was the outcome in >10% of patients with TB and COVID-19. A range of demographic and clinical predictors are associated with adverse outcomes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,019

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,002
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,078
Tête enseignante GPT0,397
Écart entre enseignants0,319 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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