Abstract EC.10: Transcriptional Heterogeneity Of The Postnatal Cardiac Conduction System
Notice bibliographique
Résumé
The cardiac conduction system (CCS) is a network of specialized cardiomyocytes responsible for the coordinated spreading of electrical impulses throughout the heart for synchronized contractions. The CCS is largely made up of the sinoatrial node (SAN), atrioventricular node (AVN) and the fast-conducting ventricular conduction system (VCS), which is further divided into the His bundle, Bundle branches and Purkinje fibers. Although these CCS structures were anatomically discovered >100 years ago, their molecular constituents are not fully known. In this study, CCS cells, making up ~0.05% of myocytes (~500 cells/heart), were isolated from early postnatal hearts (postnatal day 1 to 4) of fluorescent reporter mice (Cntn2-Cre;Rosa26TdTomato), purified using fluorescence-activated cell sorting, and subjected to single-cell RNA-sequencing. Unbiased cluster analysis on ~7000 CCS cells demonstrated distinct transcriptomic profiles in the SAN, AVN, proximal VCS ( His bundle, bundle branches) and distal VCS ( Purkinje fibers). Conforming to previous studies, global conduction markers, such as Cntn2 and Id2, were present throughout the entire CCS, while a VCS-specific transcription factor, Irx3 , was expressed only in the VCS. A comparison between proximal and distal VCS components revealed enrichments of Igfbp7 , Lyz2 and Sfrp5 in the proximal VCS, and Scn10a , Psd3 and Wisp1 in the distal VCS. Sub-clustering analysis followed by validation with immunostaining further identified unique molecular profiles of the SAN ( Shox2 , Vsnl1 ), AVN ( Rspo3 ), His bundle ( S100a6 , Pcp4 ) and bundle branches ( Nppa , Mest ). Data integrating publicly available ATAC-seq in SAN, AV junction, and atrial and ventricular cardiomyocytes as well as Tbx3-ChIP-seq, suggested that these regional markers are possibly regulated by two CCS-specific transcription factors, Irx3 and Tbx3 . More importantly, overexpressing Irx3 and/or Tbx3 in cultured neonatal mouse atrial and ventricular myocytes recapitulated these region-specific expression patterns in a dish. Together, our study provides a comprehensive view of the molecular profiles within the postnatal CCS at a high-resolution and show Irx3 and Tbx3 as genetic regulators establishing heterogeneities of the CCS.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».