Abstract P2101: Elucidating Heterogeneity Between Left And Right Ventricle-derived Cardiac Fibroblasts
Notice bibliographique
Résumé
Cardiac fibrosis is a major risk factor for cardiovascular disease, leading to impaired electrical conduction and reduced ventricular compliance in the heart. Different pathophysiologic conditions can lead to fibrosis in the left ventricle (LV) and/or right ventricle (RV). Despite building evidence to support the transcriptomic heterogeneity of cardiac fibroblasts (CFs) in healthy and diseased states, there have been no direct comparisons of CFs in the LV and RV. Due to the developmental and physiologic differences between the two ventricles, we hypothesized that LV and RV-derived CFs would display transcriptomic differences that influence their proliferation and differentiation following injury. Bulk RNA-seq data from the LVs and RVs of uninjured male mice revealed 442 differentially expressed genes (p<0.05, n=4) with numerous fibrosis-related genes such as Igfbp3 , Col8a1 , Ctgf , Aspn , and Postn being the most significantly different. Single-cell RNA-seq analysis of CFs from uninjured tissue identified nine subpopulations, two of which displayed LV vs RV differences. CFs marked by high expression of Postn , Col8a1 , and Ctgf were more abundant in the LV, whereas CFs marked by high expression of Igfbp3 , Fgl2 , and Sfrp2 were more abundant in the RV. Comparisons with published datasets suggest that Postn -high CFs are primed for differentiation into injury-induced CFs. While the Igfbp3 -high population has not previously been described, top marker genes have mixed pro- and anti-fibrotic roles. We then used surgical models of pressure overload injury (TAC and PAB) to study changes in the transcriptome of LV and RV-derived CFs respectively at 14 days post-surgery. Single cell RNA-seq analysis showed that the LV developed a larger population of pro-fibrotic Thbs4 +/ Cthrc1 + injury-induced CFs while the RV uniquely showed expansion of Igfbp3 - and Inmt -high CFs. Injury experiments were repeated with female mice and showed the same results. These findings demonstrate that LV and RV-derived CFs display subpopulation differences that may cause their diverging responses to pressure overload injury. Further study of these subpopulations will elucidate their role in the development of fibrosis and inform whether LV and RV fibrosis require distinct treatments.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».