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Enregistrement W4387621084 · doi:10.1161/res.133.suppl_1.p2101

Abstract P2101: Elucidating Heterogeneity Between Left And Right Ventricle-derived Cardiac Fibroblasts

2023· article· en· W4387621084 sur OpenAlexaff
Michael Dewar, Haisam Shah, Dylan Langburt, Fahad Ehsan, Alison Hacker, Scott P. Heximer

Notice bibliographique

RevueCirculation Research · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTissue Engineering and Regenerative Medicine
Établissements canadiensQueen's UniversityMcGill UniversityUniversity of TorontoSt. Michael's Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCTGFVentricleIGFBP3FibrosisTranscriptomeInternal medicinePopulationCardiac fibrosisMedicineCardiologyBiologyGene expressionGrowth factorGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cardiac fibrosis is a major risk factor for cardiovascular disease, leading to impaired electrical conduction and reduced ventricular compliance in the heart. Different pathophysiologic conditions can lead to fibrosis in the left ventricle (LV) and/or right ventricle (RV). Despite building evidence to support the transcriptomic heterogeneity of cardiac fibroblasts (CFs) in healthy and diseased states, there have been no direct comparisons of CFs in the LV and RV. Due to the developmental and physiologic differences between the two ventricles, we hypothesized that LV and RV-derived CFs would display transcriptomic differences that influence their proliferation and differentiation following injury. Bulk RNA-seq data from the LVs and RVs of uninjured male mice revealed 442 differentially expressed genes (p<0.05, n=4) with numerous fibrosis-related genes such as Igfbp3 , Col8a1 , Ctgf , Aspn , and Postn being the most significantly different. Single-cell RNA-seq analysis of CFs from uninjured tissue identified nine subpopulations, two of which displayed LV vs RV differences. CFs marked by high expression of Postn , Col8a1 , and Ctgf were more abundant in the LV, whereas CFs marked by high expression of Igfbp3 , Fgl2 , and Sfrp2 were more abundant in the RV. Comparisons with published datasets suggest that Postn -high CFs are primed for differentiation into injury-induced CFs. While the Igfbp3 -high population has not previously been described, top marker genes have mixed pro- and anti-fibrotic roles. We then used surgical models of pressure overload injury (TAC and PAB) to study changes in the transcriptome of LV and RV-derived CFs respectively at 14 days post-surgery. Single cell RNA-seq analysis showed that the LV developed a larger population of pro-fibrotic Thbs4 +/ Cthrc1 + injury-induced CFs while the RV uniquely showed expansion of Igfbp3 - and Inmt -high CFs. Injury experiments were repeated with female mice and showed the same results. These findings demonstrate that LV and RV-derived CFs display subpopulation differences that may cause their diverging responses to pressure overload injury. Further study of these subpopulations will elucidate their role in the development of fibrosis and inform whether LV and RV fibrosis require distinct treatments.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,098
Tête enseignante GPT0,393
Écart entre enseignants0,295 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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