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Enregistrement W4387704276 · doi:10.32942/x2wk6t

Multinational evaluation of genetic diversity indicators for the Kunming-Montreal Global Biodiversity Monitoring framework

2023· preprint· en· W4387704276 sur OpenAlexaboutno aff
Alicia Mastretta‐Yanes, Jessica M. da Silva, Catherine E. Grueber, Luis Castillo‐Reina, Viktoria Köppä, Brenna R. Forester, William H. Funk, Myriam Heuertz, Fumiko Ishihama, Rebecca Jordan, Joachim Mergeay, Ivan Paz‐Vinas, Víctor J. Rincón-Parra, Maria Rodriguez‐Morales, Libertad Arredondo‐Amezcua, Gaëlle Brahy, Matt DeSaix, Lily F. Durkee, Ashley Hamilton, Austin Koontz, Iris Lang, M C Latorre, Tanya Latty, Alexander Llanes‐Quevedo, Anna J. MacDonald, Meg Mahoney, Caitlin V. Miller, Juan Francisco Ornelas, Santiago Ramírez‐Barahona, Erica Robertson, Isa‐Rita M. Russo, Metztli Arcila Santiago, Robyn E. Shaw, Glenn M. Shea, Per Sjögren‐Gulve, Emma Spence, Taylor Stack, Sofia Suárez, A. Takénaka, Henrik Thurfjell, Sheela P. Turbek, Marlien van der Merwe, Fleur Visser, Ana Wegier, Georgina Wood, Eugenia Zarza, Linda Laikre, Sean Hoban

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesU.S. Geological SurveySvenska Forskningsrådet FormasAgence Nationale de la RechercheFordham University
Mots-clésBiodiversityConvention on Biological DiversityTaxonGenetic diversityHeadlineGeographyEcologyPopulationDiversity (politics)Indicator valueBiologyDemographyPolitical scienceBusiness

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In December 2022, the United Nations Convention on Biological Diversity (CBD) adopted the Kunming-Montreal Global Biodiversity Framework, in which 196 Parties, for the first time, committed to report on the status of genetic diversity for all species. To facilitate this reporting, three genetic diversity indicators were developed, two of which focus on the processes contributing to genetic diversity loss: the loss of genetically distinct populations (measured by complementary indicator “proportion of populations maintained within species”) and populations being too small to maintain genetic diversity (measured by headline indicator A4, “The proportion of populations within species with an effective population size > 500”). The major advantage of these indicators is that they can be estimated without DNA-based data. However, demonstrating the feasibility of this approach to all Parties for their national reporting, requires addressing methodological challenges of using empirical data gathered from diverse sources, across diverse taxonomic groups and for countries of varying socio-economic status and biodiversity levels. Here, we assess the genetic indicators for 919 taxa, representing 5,271 populations across nine countries, including megadiverse and developing economies. Data were available to calculate indicators for each country and taxonomic group (765 taxa [83%] had data for at least one indicator). Additionally, 41% of taxa (n=518) have lost at least one-tenth of their populations (complementary indicator [populations maintained] value < 0.9), while 58% of taxa (n=568) have all populations too small to sustain genetic diversity (headline indicator [Ne 500] value = 0). By comparing taxon indicator values to their GlobalRed List status, range size, and other factors, we found the loss of genetic diversity shown by these indicators would go unnoticed by other biodiversity assessments, highlighting the critical importance of monitoring and conserving genetic diversity using these indicators.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,127
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,144
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,623
Score d'incertitude au seuil0,758

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1270,144
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0080,012
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0050,003
Science ouverte0,0050,004
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,052
Tête enseignante GPT0,316
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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