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Enregistrement W4387736865 · doi:10.1101/2023.10.13.23296991

Automated and Interpretable Detection of Hippocampal Sclerosis in temporal lobe epilepsy: AID-HS

2023· preprint· en· W4387736865 sur OpenAlexaff
Mathilde Ripart, Jordan DeKraker, Maria H. Eriksson, Rory J. Piper, Jiajie Mo, Ting‐Yu Su, Ryuzaburo Kochi, Irène Wang, Gavin P. Winston, Chris A. Clark, Felice D’Arco, Kshitij Mankad, Ali R. Khan, Torsten Baldeweg, Sophie Adler, Konrad Wagstyl

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueEpilepsy research and treatment
Établissements canadiensWestern UniversityQueen's UniversityMcGill University
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilRosetrees TrustEpilepsy Research UK
Mots-clésHippocampal sclerosisTemporal lobeEpilepsyHippocampal formationCohortMedicineLogistic regressionCortical dysplasiaMagnetic resonance imagingRadiologyPathologyPsychologyNeuroscienceInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Hippocampal Sclerosis (HS) can elude visual detection on MRI scans of patients with temporal lobe epilepsy (TLE), causing delays in surgical treatment and reducing the likelihood of postsurgical seizure-freedom. We developed an open-source software that (1) detects HS from structural MRI scans, (2) generalises across a heterogeneous multicentre cohort of children and adults, and (3) generates individualised predictions for clinical evaluation. We included a cohort of 363 participants (152 patients with HS, 90 disease controls with focal cortical dysplasia, and 121 healthy controls) from four epilepsy centres in the UK, North America, and China. We used the open-source software HippUnfold to extract morphological surface-based features and volumes of the hippocampus from T1w MRI scans. We compared pathological hippocampal morphology in patients with HS to normative growth charts generated from healthy controls, and to the contralateral hippocampi in patients with HS. HS was characterised by decreased volume, thickness and gyrification as well as increased mean and intrinsic curvature. A logistic regression classifier trained on these features detected 90.1% of HS patients, and accurately lateralised 97.4% of the HS cohort. Crucially, in patients with MRI-negative histopathologically confirmed HS, the classifier detected HS in 79.2% (19/24) and accurately lateralised the lesions in 91.7% (22/24). The Automated and Interpretable Detection of Hippocampal Sclerosis classifier (AID-HS) was packaged into an open-source pipeline, which detects and lateralises HS and generates individualised patient reports that characterise hippocampal developmental abnormalities. AID-HS is capable of accurately detecting and lateralising HS in a large, heterogeneous, multi-centre, cohort of paediatric and adult patients with diagnostically challenging HS. Moreover, by offering transparent, robust and interpretable results, AID-HS can support the presurgical evaluation of patients with suspected TLE.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,049
Tête enseignante GPT0,315
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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