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Enregistrement W4387773652 · doi:10.1186/s13567-023-01221-6

Exploring the alternative virulence determinants PB2 S155N and PA S49Y/D347G that promote mammalian adaptation of the H9N2 avian influenza virus in mice

2023· article· en· W4387773652 sur OpenAlexaff
Yanna Guo, Xuebing Bai, Zhiyuan Liu, Bing Liang, Yiqing Zheng, Samar Dankar, Jihui Ping

Notice bibliographique

RevueVeterinary Research · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInfluenza Virus Research Studies
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesState Key Laboratory of Veterinary BiotechnologyFundamental Research Funds for the Central UniversitiesNational Key Research and Development Program of ChinaNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésBiologyVirologyInfluenza A virus subtype H5N1VirulenceHost adaptationViral replicationVirusInfluenza A virusGenePolymeraseGeneticsMicrobiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The occurrence of human infections caused by avian H9N2 influenza viruses has raised concerns regarding the potential for human epidemics and pandemics. The molecular basis of viral adaptation to a new host needs to be further studied. Here, the bases of nucleotides 627 and 701 of PB2 were changed according to the uncoverable purine-to-pyrimidine transversion to block the development of PB2 627K and 701N mutations during serial passaging in mice. The purpose of this experiment was to identify key adaptive mutations in polymerase and NP genes that were obscured by the widely known host range determinants PB2 627K and 701N. Mouse-adapted H9N2 variants were obtained via twelve serial lung-to-lung passages. Sequence analysis showed that the mouse-adapted viruses acquired several mutations within the seven gene segments (PB2, PB1, PA, NP, HA, NA, and NS). One variant isolate with the highest polymerase activity possessed three substitutions, PB2 S155N, PA S49Y and D347G, which contributed to the highly virulent and mouse-adaptative phenotype. Further studies demonstrated that these three mutations resulted in increased polymerase activity, viral transcription and replication in mammalian cells, severe interstitial pneumonia, excessive inflammatory cellular infiltration and increased growth rates in mice. Our results suggest that the substitution of these three amino acid mutations may be an alternative strategy for H9N2 avian influenza viruses to adapt to mammalian hosts. The continued surveillance of zoonotic H9N2 influenza viruses should also include these mammalian adaptation markers as part of our pandemic preparedness efforts.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,716
Score d'incertitude au seuil0,534

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,627
Tête enseignante GPT0,484
Écart entre enseignants0,143 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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