MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4387776917 · doi:10.3389/frai.2023.1200994

Machine learning algorithms in microbial classification: a comparative analysis

2023· review· en· W4387776917 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Artificial Intelligence · 2023
Typereview
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueImage Processing Techniques and Applications
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésMachine learningArtificial intelligenceComputer scienceDeep learningConvolutional neural networkIdentification (biology)Context (archaeology)Transfer of learningRepurposingContextual image classificationImage (mathematics)Engineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This research paper presents an overview of contemporary machine learning methodologies and their utilization in the domain of healthcare and the prevention of infectious diseases, specifically focusing on the classification and identification of bacterial species. As deep learning techniques have gained prominence in the healthcare sector, a diverse array of architectural models has emerged. Through a comprehensive review of pertinent literature, multiple studies employing machine learning algorithms in the context of microbial diagnosis and classification are examined. Each investigation entails a tabulated presentation of data, encompassing details about the training and validation datasets, specifications of the machine learning and deep learning techniques employed, as well as the evaluation metrics utilized to gauge algorithmic performance. Notably, Convolutional Neural Networks have been the predominant selection for image classification tasks by machine learning practitioners over the last decade. This preference stems from their ability to autonomously extract pertinent and distinguishing features with minimal human intervention. A range of CNN architectures have been developed and effectively applied in the realm of image classification. However, addressing the considerable data requirements of deep learning, recent advancements encompass the application of pre-trained models using transfer learning for the identification of microbial entities. This method involves repurposing the knowledge gleaned from solving alternate image classification challenges to accurately classify microbial images. Consequently, the necessity for extensive and varied training data is significantly mitigated. This study undertakes a comparative assessment of various popular pre-trained CNN architectures for the classification of bacteria. The dataset employed is composed of approximately 660 images, representing 33 bacterial species. To enhance dataset diversity, data augmentation is implemented, followed by evaluation on multiple models including AlexNet, VGGNet, Inception networks, Residual Networks, and Densely Connected Convolutional Networks. The results indicate that the DenseNet-121 architecture yields the optimal performance, achieving a peak accuracy of 99.08%, precision of 99.06%, recall of 99.00%, and an F1-score of 98.99%. By demonstrating the proficiency of the DenseNet-121 model on a comparatively modest dataset, this study underscores the viability of transfer learning in the healthcare sector for precise and efficient microbial identification. These findings contribute to the ongoing endeavors aimed at harnessing machine learning techniques to enhance healthcare methodologies and bolster infectious disease prevention practices.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,992
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,005
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,136
Tête enseignante GPT0,377
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle