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Enregistrement W4387865472 · doi:10.1001/jamanetworkopen.2023.38995

Testing and Management of Iron Overload After Genetic Screening–Identified Hemochromatosis

2023· article· en· W4387865472 sur OpenAlexaff
Juliann M. Savatt, Alicia Johns, M. Schwartz, Whitney S. McDonald, Zachary Salvati, Nicole M. Oritz, Max Masnick, Kathryn E. Hatchell, Jing Hao, Adam H. Buchanan, Marc S. Williams

Notice bibliographique

RevueJAMA Network Open · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueIron Metabolism and Disorders
Établissements canadiensSickKids FoundationTed Rogers Centre for Heart ResearchHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHemochromatosisMedicineBiobankHereditary hemochromatosisAsymptomaticGenetic testingInternal medicineGeneticsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Importance: HFE gene-associated hereditary hemochromatosis type 1 (HH1) is underdiagnosed, resulting in missed opportunities for preventing morbidity and mortality. Objective: To assess whether screening for p.Cys282Tyr homozygosity is associated with recognition and management of asymptomatic iron overload. Design, Setting, and Participants: This cross-sectional study obtained data from the Geisinger MyCode Community Health Initiative, a biobank of biological samples and linked electronic health record data from a rural, integrated health care system. Participants included those who received a p.Cys282Tyr homozygous result via genomic screening (MyCode identified), had previously diagnosed HH1 (clinically identified), and those negative for p.Cys282Tyr homozygosity between 2017 and 2018. Data were analyzed from April 2020 to August 2023. Exposure: Disclosure of a p.Cys282Tyr homozygous result. Main Outcomes and Measures: Postdisclosure management and HFE-associated phenotypes in MyCode-identified participants were analyzed. Rates of HFE-associated phenotypes in MyCode-identified participants were compared with those of clinically identified participants. Relevant laboratory values and rates of laboratory iron overload among participants negative for p.Cys282Tyr homozygosity were compared with those of MyCode-identified participants. Results: A total of 86 601 participants had available exome sequences at the time of analysis, of whom 52 994 (61.4%) were assigned female at birth, and the median (IQR) age was 62.0 (47.0-73.0) years. HFE p.Cys282Tyr homozygosity was disclosed to 201 participants, of whom 57 (28.4%) had a prior clinical HH1 diagnosis, leaving 144 participants who learned of their status through screening. There were 86 300 individuals negative for p.Cys282Tyr homozygosity. After result disclosure, among MyCode-identified participants, 99 (68.8%) had a recommended laboratory test and 36 (69.2%) with laboratory or liver biopsy evidence of iron overload began phlebotomy or chelation. Fifty-three (36.8%) had iron overload; rates of laboratory iron overload were higher in MyCode-identified participants than participants negative for p.Cys282Tyr homozygosity (females: 34.1% vs 2.1%, P < .001; males: 39.0% vs 2.9%, P < .001). Iron overload (females: 34.1% vs 79.3%, P < .001; males: 40.7% vs 67.9%, P = .02) and some liver-associated phenotypes were observed at lower frequencies in MyCode-identified participants compared with clinically identified individuals. Conclusions and Relevance: Results of this cross-sectional study showed the ability of genomic screening to identify undiagnosed iron overload and encourage relevant management, suggesting the potential benefit of population screening for HFE p.Cys282Tyr homozygosity. Further studies are needed to examine the implications of genomic screening for health outcomes and cost-effectiveness.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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