<i>Chlamydia suis</i>displays high transformation capacity with complete cloning vector integration into the chromosomal<i>rrn-nqrF</i>plasticity zone
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Chlamydia, comprising several human and zoonotic pathogens, is a genus of the conserved bacterial phylum Chlamydiota. Their obligate intracellular niche serves as a barrier for natural genetic exchange via horizontal gene transfer (HGT), and further limits the development and application of genetic tools. To date, the only example for recent inter-phylum HGT among the Chlamydiota is tetracycline resistance in the potentially zoonotic speciesChlamydia suis, a close phylogenetic relative of humanC. trachomatis, which causes bacterial sexually transmitted infections and ocular trachoma. Tetracycline resistance in porcineC. suisstrains has been described worldwide and is always part of a genomic island dividinginvasin(inv), located within a chromosomal region between the rRNA operon (rrn) and thenqrFreductase. Here, we aimed to expand the still modest number of available genetic manipulation systems forChlamydiaby generating allele-replacement and integration vectors forC. suis. These vectors comprised homologousC. suissequences of the chromosomal region of interest, anE. coliorigin of replication (ori) and selection markers but lacked the native chlamydial plasmids or itsori. We first recovered allele-replacement mutants using a vector that targets the tryptophan (trp) operon ofC. suis. The vector was further successfully maintained as a free plasmid inC. trachomatiswithout allele replacement, suggesting complex plasmid dynamics in the absence of a chlamydialori. Moreover, we showed that the hypervariablerrn-nqrFintergenic region ofC. suisis highly susceptible to transformation, resulting in complete vector integration upstream ofnqrFwithout interruption of the targetedinvgene. IMPORTANCE The obligate intracellularChlamydiagenus contains many pathogens with a negative impact on global health and economy. Despite recent progress, there is still a lack of genetic tools limiting our understanding of these complex bacteria. This study provides new insights into genetic manipulation ofChlamydiawith the opportunistic porcine pathogenChlamydia suis, the only chlamydial species naturally harboring an antibiotic resistance gene, originally obtained by horizontal gene transfer.C. suisis transmissible to humans, posing a potential public health concern. We report thatC. suiscan take up vectors that lack the native plasmid, a requirement for most chlamydial transformation systems described to date. Additionally, we show thatC. trachomatis, the most common cause for bacterial sexually transmitted infections and infectious blindness worldwide, can be transformed withC. suisvectors. Finally, the chromosomal region that harbors the resistance gene ofC. suisis highly susceptible to complete vector integration.
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Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».