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Enregistrement W4387963612 · doi:10.48550/arxiv.2310.16161

MyriadAL: Active Few Shot Learning for Histopathology

2023· preprint· en· W4387963612 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevuearXiv (Cornell University) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueMachine Learning and Algorithms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchAlberta Innovates
Mots-clésComputer scienceArtificial intelligenceMachine learningOracleActive learning (machine learning)EncoderSupervised learningData miningArtificial neural network

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Active Learning (AL) and Few Shot Learning (FSL) are two label-efficient methods which have achieved excellent results recently. However, most prior arts in both learning paradigms fail to explore the wealth of the vast unlabelled data. In this study, we address this issue in the scenario where the annotation budget is very limited, yet a large amount of unlabelled data for the target task is available. We frame this work in the context of histopathology where labelling is prohibitively expensive. To this end, we introduce an active few shot learning framework, Myriad Active Learning (MAL), including a contrastive-learning encoder, pseudo-label generation, and novel query sample selection in the loop. Specifically, we propose to massage unlabelled data in a self-supervised manner, where the obtained data representations and clustering knowledge form the basis to activate the AL loop. With feedback from the oracle in each AL cycle, the pseudo-labels of the unlabelled data are refined by optimizing a shallow task-specific net on top of the encoder. These updated pseudo-labels serve to inform and improve the active learning query selection process. Furthermore, we introduce a novel recipe to combine existing uncertainty measures and utilize the entire uncertainty list to reduce sample redundancy in AL. Extensive experiments on two public histopathology datasets show that MAL has superior test accuracy, macro F1-score, and label efficiency compared to prior works, and can achieve a comparable test accuracy to a fully supervised algorithm while labelling only 5% of the dataset.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,945
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,122
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,105 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle