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Enregistrement W4387977110 · doi:10.1101/2023.10.24.563795

The rapid diversification of Boletales is linked to Early Eocene and Mid-Miocene Climatic Optima

2023· preprint· en· W4387977110 sur OpenAlexaff
Gang Wu, Kui Wu, Roy E. Halling, Egon Horak, Jianping Xu, Guang-Mei Li, Serena Lee, Lorenzo Pecoraro, Roberto Flores Arzú, Sydney T. Ndolo Ebika, Souhila Aouali, Anna Maria Persiani, Nourou S. Yorou, Xin Xu, Bang Feng, Yan-Chun Li, Zhu‐Liang Yang

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueMycorrhizal Fungi and Plant Interactions
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesInstitute of Botany, Chinese Academy of SciencesKunming Institute of Botany, Chinese Academy of SciencesRecruitment Program of Global ExpertsNational Ten Thousand Talent ProgramNatural Science Foundation of Yunnan ProvinceHunan Normal UniversityNational Natural Science Foundation of ChinaSun Yat-sen UniversityChinese Academy of SciencesUniversity of the Punjab
Mots-clésEcologyBiologyDiversification (marketing strategy)Paleontology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

SUMMARY Investigating the mechanisms that underpin the diversity and distribution patterns of species is fundamental in ecology and evolution. However, the study of fungi, particularly the ectomycorrhizal group, has been relatively constrained in this field. We conducted a high-resolution phylogenomic analysis of Boletales, an ecologically and economically significant group of fungi, covering 83 genera across 15 families. We subsequently investigated its evolutionary history using sequences at four genes obtained from 984 species across 121 genera within 15 families. The findings unveiled that Boletales likely originated in Early Jurassic and underwent two remarkable episodes of rapid diversification, commencing in early Eocene (∼54 Mya) and early Miocene (∼17 Mya) epochs. The notable surges were predominantly driven by ectomycorrhizal clades, with a specific emphasis on East Asia and North America. These expansions were strongly correlated with the warm-humid paleoclimates during the Early Eocene Climatic Optimum and Mid-Miocene Climatic Optimum, as well as the rapid expansion of Fagales and Pinaceae hosts. This study provides novel insights into the spatiotemporal evolution of fungi, highlighting the synergistic impact of abiotic factors, such as warm and humid paleoclimates, and the biotic factor of rapid diversification of host plants on the fungal diversification.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,191 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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