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Enregistrement W4388042143 · doi:10.1172/jci157165

Single-cell transcriptomics and chromatin accessibility profiling elucidate the kidney-protective mechanism of mineralocorticoid receptor antagonists

2023· article· en· W4388042143 sur OpenAlexaff
Amin Abedini, Junnan Wu, Konstantin A. Klötzer, Ziyuan Ma, Bibek Poudel, Tomohito Doke, Michael S. Balzer, Julia Frederick, Hana Černecká, Hongbo Liu, Xiujie Liang, Steven Vitale, Peter Kolkhof, Katalin Suszták

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Investigation · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHormonal Regulation and Hypertension
Établissements canadiensInstitute of Nutrition, Metabolism and Diabetes
Organismes subventionnairesPerelman School of Medicine, University of PennsylvaniaNational Institutes of HealthOeAD-GmbHMedizinische Universität GrazNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesKarl-Franzens-Universität GrazDeutsche ForschungsgemeinschaftUniversity of Pennsylvania
Mots-clésMineralocorticoid receptorEndocrinologyEpithelial sodium channelInternal medicineMineralocorticoidKidneyAlbuminuriaAldosteroneKidney diseaseDistal convoluted tubuleBiologyMedicineChemistryReabsorptionSodium

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mineralocorticoid excess commonly leads to hypertension (HTN) and kidney disease. In our study, we used single-cell expression and chromatin accessibility tools to characterize the mineralocorticoid target genes and cell types. We demonstrated that mineralocorticoid effects were established through open chromatin and target gene expression, primarily in principal and connecting tubule cells and, to a lesser extent, in segments of the distal convoluted tubule cells. We examined the kidney-protective effects of steroidal and nonsteroidal mineralocorticoid antagonists (MRAs), as well as of amiloride, an epithelial sodium channel inhibitor, in a rat model of deoxycorticosterone acetate, unilateral nephrectomy, and high-salt consumption-induced HTN and cardiorenal damage. All antihypertensive therapies protected against cardiorenal damage. However, finerenone was particularly effective in reducing albuminuria and improving gene expression changes in podocytes and proximal tubule cells, even with an equivalent reduction in blood pressure. We noted a strong correlation between the accumulation of injured/profibrotic tubule cells expressing secreted posphoprotein 1 (Spp1), Il34, and platelet-derived growth factor subunit b (Pdgfb) and the degree of fibrosis in rat kidneys. This gene signature also showed a potential for classifying human kidney samples. Our multiomics approach provides fresh insights into the possible mechanisms underlying HTN-associated kidney disease, the target cell types, the protective effects of steroidal and nonsteroidal MRAs, and amiloride.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,103
Tête enseignante GPT0,357
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations40
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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