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Enregistrement W4388103742 · doi:10.1101/2023.10.26.563793

A mathematical model of the Alzheimer’s Disease biomarker cascade demonstrates statistical pitfalls in identifying neurobiological surrogates of cognitive reserve

2023· preprint· en· W4388103742 sur OpenAlexfundno aff
Florian U. Fischer, Susanne Gerber, Oliver Tüscher

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAlzheimer's disease research and treatments
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchUniversitätsmedizin der Johannes Gutenberg-Universität MainzNational Institutes of HealthGenentechIXICOH. Lundbeck A/SServierEisaiNorthern California Institute for Research and EducationF. Hoffmann-La RocheUniversity of Southern CaliforniaBiogenEli Lilly and CompanyBristol-Myers SquibbBioClinicaU.S. Department of DefenseMeso Scale DiagnosticsAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeNovartis Pharmaceuticals CorporationPfizerAlzheimer's Association
Mots-clésCognitive reserveCognitionAlzheimer's diseaseHippocampal formationSample size determinationBiomarkerNeurosciencePsychologyConfoundingAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeNeurodegenerationSample (material)StatisticsDiseaseInternal medicineCognitive impairmentMedicineBiologyMathematicsChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Introduction In order to investigate neurobiological surrogates of cognitive reserve, statistical interaction analyses have been put forward and used by several studies. However, as these neurobiological surrogates are potentially affected by neurodegeneration as part of the amyloid cascade, which is characterized by chronological time-moderated associations between biomarkers, cross sectional sampling in combination with the disregard of time as a confounder could introduce interaction effects that may be misinterpretabed as cognitive reserve in statistical analyses. Methods We modeled the amyloid cascade with a minimal set of three biomarkers amyloid load, corticospinal fluid tau, hippocampal volume and cognitive outcome using a differential equation system, whose parameters were estimated from empirical data from the ADNI. Interaction effects between pathology markers amyloid and tau with hippocampal volume as potential marker of cognitive reserve were estimated on two simulated data samples. Both samples were calculated from varying amyloid, tau and hippocampal volume for the initial configuration of individual trajectories. For Sample 1, data points were sampled at a fixed time after baseline. For Sample 2, data points were sampled at random time points. Results Regression analyses on Sample 1 yielded estimates for interaction effects of 0. For Sample 2, estimates were -.1692 and -.0807 for amyloid and tau with hippocampal volume, respectively. The interaction effect estimates for Sample 2 decreased several orders of magnitude when taking into account the timepoint of sampling. Conclusion Studies aiming to investigate neurobiological surrogates of cognitive reserve that are affected by Alzheimer’s Disease-related neurodegenerative processes need to consider inter-individually varying sampling time points in the data to avoid misinterpreting interaction effects.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,012
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,995
Score d'incertitude au seuil0,027

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,012
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,103
Tête enseignante GPT0,331
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSimulation ou modélisation
DomaineMéthodes
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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