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Enregistrement W4388126090 · doi:10.1371/journal.pone.0293167

Pangenomic antiviral effect of REP 2139 in CRISPR/Cas9 engineered cell lines expressing hepatitis B virus surface antigen

2023· article· en· W4388126090 sur OpenAlexafffund
Léna Angelo, Andrew Vaillant, Matthieu Blanchet, Patrick Labonté

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHepatitis B Virus Studies
Établissements canadiensInstitut National de la Recherche Scientifique
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésHBsAgVirologyHepatitis B virusBiologyEntecavirHepatocellular carcinomaVirusLamivudineCancer research

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Chronic hepatitis B remains a global health problem with 296 million people living with chronic HBV infection and being at risk of developing cirrhosis and hepatocellular carcinoma. Non-infectious subviral particles (SVP) are produced in large excess over infectious Dane particles in patients and are the major source of Hepatitis B surface antigen (HBsAg). They are thought to exhaust the immune system, and it is generally considered that functional cure requires the clearance of HBsAg from blood of patient. Nucleic acid polymers (NAPs) antiviral activity lead to the inhibition of HBsAg release, resulting in rapid clearance of HBsAg from circulation in vivo. However, their efficacy has only been demonstrated in limited genotypes in small scale clinical trials. HBV exists as nine main genotypes (A to I). In this study, the HBsAg ORFs from the most prevalent genotypes (A, B, C, D, E, G), which account for over 96% of human cases, were inserted into the AAVS1 safe-harbor of HepG2 cells using CRISPR/Cas9 knock-in. A cell line producing the D144A vaccine escape mutant was also engineered. The secretion of HBsAg was confirmed into these new genotype cell lines (GCLs) and the antiviral activity of the NAP REP 2139 was then assessed. The results demonstrate that REP 2139 exerts an antiviral effect in all genotypes and serotypes tested in this study, including the vaccine escape mutant, suggesting a pangenomic effect of the NAPs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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