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Enregistrement W4388226645 · doi:10.1016/j.jcs.2023.103805

Partial C-terminal truncation of Bx and Dy high molecular weight glutenin subunits after conserved aspartate

2023· article· en· W4388226645 sur OpenAlexaff
Ray Bacala, D. W. Hatcher, Hélène Perreault, Bin Xiao Fu

Notice bibliographique

RevueJournal of Cereal Science · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCeliac Disease Research and Management
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGluteninGlutenWheat glutenConserved sequenceBiologyBiochemistryFunction (biology)Residue (chemistry)ChemistryGeneticsProtein subunitPeptide sequenceGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The composition of polymeric gluten proteins and interaction with non-covalently associated gliadins define the functional utility of a flour. This composition is dictated by the timing of cellular and genetic events in the plant and the developing seed. This interplay and its effect on gluten functionality is poorly understood and could provide a new opportunity for improving wheat quality in the future. Truncated proteoforms of high-molecular weight glutenin subunits (HMWGS) were observed for Bx and Dy subtypes across 49 Canadian bread wheat and 16 durum varieties. The relative abundances of these variants ranged from 7.5% to 37.7% and abundances of Bx and Dy variants were highly correlated (r2 = 0.85). HMWGS Bx7* and Dy10 were purified and the mass difference was shown to be from the loss of a C-terminal hexapeptide after a conserved aspartate residue. This aspartate was present at the ω-7 position in >90% of HMWGS accessions and the C-terminal sequence was highly conserved. Importantly, all HMWGS subtypes contain the same conserved sequences, but truncated variants were never observed for By, Dx and Ax HMWGS. The potential impact of these truncated HMWGS on gluten form and function is discussed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,305
Écart entre enseignants0,291 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentnon

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