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Enregistrement W4388300944 · doi:10.1101/2023.10.31.564979

Structural determinants of pure antiestrogenicity

2023· preprint· en· W4388300944 sur OpenAlexaff
Marine Diennet, Faraz Shaikh, Mohamed El Ezzy, Khady Thiombane, Sandra Weber, Julien Poupart, Rodrigo Mendoza‐Sanchez, Zu‐Hua Gao, James L. Gleason, Doris A. Schuetz, Geoffrey L. Greene, Anne Marinier, Sean W. Fanning, Sylvie Mader

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueUbiquitin and proteasome pathways
Établissements canadiensUniversité de MontréalMcGill UniversityUniversity of British ColumbiaInstitute for Research in Immunology and Cancer
Organismes subventionnairesBiological and Environmental ResearchOffice of ScienceArgonne National LaboratorySusan G. Komen for the CureU.S. Department of Energy
Mots-clésCoactivatorSUMO proteinFulvestrantChemistryEstrogen receptorEstrogen receptor alphaCell biologyCancer researchBiophysicsTranscription factorBiochemistryBiologyGeneticsCancerUbiquitinBreast cancerGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Inhibitory activities of antiestrogens on estrogen receptor alpha (ERα) range from mixed antagonism/agonism (selective ER modulators; SERMs) to complete antiestrogenicity associated with accelerated ERα turnover (selective ER degraders; SERDs). Here, we show using a panel of SERMs, SERDs and a PROTAC that efficient induction of ERα SUMOylation better accounts for complete transcriptional repression than increased suppression of coactivator recruitment or accelerated ERα degradation. Antiestrogen-induced ERα SUMOylation depends on the hydrophobicity of N-terminal residues of ligand binding domain (LBD) helix 12 (H12). L536 mutations, including those occurring in endocrine therapy-resistant breast cancer, abolished SUMOylation with all antiestrogens. Structures of the L536S human ERα LBD bound to fulvestrant analogs and molecular dynamics simulations predict dynamic side chain interactions with wild-type ERα H12 in the coactivator-binding groove and model the impact of L536 mutations. Together, our results show that induced SUMOylation contributes to the complete suppression of ERα activity and provide insights into its structural determinants.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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