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Enregistrement W4388304697 · doi:10.3390/pathogens12111314

Optimization of a Protocol for Launching Grapevine Infection with the Biologically Active cDNA Clones of a Virus

2023· article· en· W4388304697 sur OpenAlex
Mehdi Shabanian, Caihong Li, Ali Ebadi, Valerian V. Dolja, Baozhong Meng

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevuePathogens · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Virus Research Studies
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésInfectivityBiologyComplementary DNAVirusVirologycDNA libraryRNA extractionRNAAgroinfiltrationNicotiana benthamianaGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

, designated as grapevine leafroll-associated viruses (GLRaVs). However, the specific etiological role of any of these GLRaVs in GLRD has not been demonstrated. Even though GLRaV-3 is considered the chief GLRD agent, little is known about the molecular, cellular, and pathological properties of this virus. Such a knowledge gap is due to multiple factors, including the unavailability of biologically active virus cDNA clones and the lack of reliable experimental systems for launching grapevine infection using such clones. In this work, we tested four methods for inoculating tissue-cultured grapevine plantlets with cDNA clones of GLRaV-3: (i) vacuum agro-infiltration; (ii) agro-pricking; (iii) agro-drenching; and (iv) agro-injection. We showed that vacuum agro-infiltration was the most effective of these methods. Furthermore, we examined the impacts of different experimental conditions on the survival and infectivity rate of grapevines after infiltration. To verify the infectivity rate for different treatments, we used RT-PCR, RT-qPCR, and Western blotting. We found that humidity plays a critical role in the survival of plantlets after agro-infiltration and that the use of RNA silencing suppressor and dormancy treatment both had strong effects on the infection rates. To our knowledge, the experimental protocol reported herein is the most effective system for launching the infection of grapevine using cDNA clones of grapevine viruses featuring up to a 70% infection rate. This system has strong potential to facilitate grapevine virology research including the fulfillment of Koch's postulates for GLRD and other major virus diseases as well as identifying the molecular, cellular, and pathological properties of GLRaVs and, potentially, other important grapevine viruses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,701
Score d'incertitude au seuil0,114

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,067
Tête enseignante GPT0,312
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle