MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4388412026 · doi:10.1128/msphere.00213-23

The presence of <i>Ixodes pavlovskyi</i> and <i>I. pavlovskyi</i> –borne microorganisms in Rishiri Island: an ecological survey

2023· article· en· W4388412026 sur OpenAlexaboutno aff
Aya Zamoto‐Niikura, Akiko Saigo, Masahiko Sato, Hirotaka Kobayashi, Mizuki Sasaki, Minoru Nakao, Tadaki Suzuki, Shigeru Morikawa

Notice bibliographique

RevuemSphere · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueVector-borne infectious diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesJapan Society for the Promotion of ScienceMinistry of Education, Culture, Sports, Science and TechnologyJapan Agency for Medical Research and Development
Mots-clésSandpiperEcologyBiogeographyTickGeographyZoologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Rishiri Island, towering toward the Sea of Japan, has been volcanically dormant for approximately 8,000 years. This small inhabited island is free of middle- to large-sized wildlife and a crucial stopover for wild birds migrating along various routes of the East Asian Flyway. A 5-year survey was conducted to explore the biogeography of ticks and tick-borne microorganisms. By flagging vegetation, Ixodes pavlovskyi (Pomerantzev, 1948), distributed in limited spots in the Far East, was predominantly collected (60%–80% collection) throughout the survey period. The I. pavlovskyi consisted of two haplogroups, Asahikawa-type and Rishiri-type, with the prevalence and nucleotide diversity of Rishiri-type being over 90% and 0.068, respectively. A survey of wild animals revealed that red-backed voles and wild birds, including Oriental greenfinches and black-faced buntings, are their hosts for blood feeding. Furthermore, the red-backed voles were infected with tick-borne Candidatus Ehrlichia khabarensis (5/21, 24%). Till date, microorganisms with identical gene sequences have only been reported from Khabarovsk and Vancouver. Ca . E. khabarensis gene has also been detected in host-seeking adult I. pavlovskyi . These results indicated that Rishiri Island is a refuge for both I. pavlovskyi and I. pavlovskyi –borne microorganisms. Additionally, the Babesia microti US lineage, which is vectored by Ixodes persulcatus in the Far East, appears to be maintained between I. pavlovskyi and wild rodents. Various factors have influenced the unique ecosystem of the island. The historical and ecological biogeography of Rishiri Island helps us understand the origin, evolution, and expansion of ticks and associated microorganisms. IMPORTANCE Understanding the ecology of ticks and tick-borne microorganisms is important to assess the risk of emerging tick-borne diseases. Despite the fact that the Ixodes pavlovskyi tick bites humans, we lack information including population genetics and the reason for the inadequate distribution in Japan. A 5-year survey revealed that Rishiri Island, the main stopover in the East Asian Flyway of wild birds in the northern Sea of Japan, was a refuge of I. pavlovskyi . The I. pavlovskyi included two haplogroups, which were supposed to diverge a long time before the island separated from the continent and Hokkaido mainland. The detection of microorganisms from wildlife revealed that wild birds and rodents play a role in diffusion and settlement, respectively, of not only I. pavlovskyi but also I. pavlovskyi –borne microorganisms including Candidatus Ehrlichia khabarensis and Babesia microti US lineage. Various island-specific factors control I. pavlovskyi dominance and tick-borne pathogen maintenance. The results may enable us to explain how tick-borne infectious microorganisms are transported.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,122
Score d'incertitude au seuil0,995

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuemSphereMême sujetVector-borne infectious diseasesTravaux en français237 207