MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4388451702 · doi:10.1093/jnci/djad228

RE: Use of artificial intelligence for cancer clinical trial enrollment

2023· letter· en· W4388451702 sur OpenAlexaff
Jiawen Deng, Kiyan Heybati

Notice bibliographique

RevueJNCI Journal of the National Cancer Institute · 2023
Typeletter
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueEthics in Clinical Research
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCancerMedicineClinical trialOncologyArtificial intelligenceInternal medicineComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Clinical trials represent a pivotal step in advancing novel cancer therapies from development to clinical application. Despite a strong willingness among patients to participate, however, less than 5% of adult patients with cancer are enrolled in oncology trials. Enhancing enrollment workflows can expedite treatment advances and lead to faster patient outcome improvements (1). In their review in this issue of the Journal, Chow et al. (2) found that artificial intelligence (AI) workflows for trial enrollment outperformed manual methods, with industry-developed systems having higher positive predictive values than in-house systems. Although we commend Chow et al. for their comprehensive review, we believe that certain concerns warrant further discussion. First, the AI workflows examined had substantial heterogeneities, which complicates the meta-analysis and interpretation of AI performance. AI enrollment workflows can generally be broken down into 3 steps: 1) extracting eligibility criteria from protocols, 2) extracting data from electronic health records, and 3) matching the extracted data with the eligibility criteria (3). The studies included in the review differed greatly in how they approached these steps. For instance, where Meystre et al. (3) applied AI only to the latter 2 steps, Beck et al. (4) automated all 3. Thus, the accuracy of Meystre et al.’s workflow would be less affected by AI than that of Beck et al. Meanwhile, other studies, such as Calaprice-Whitty et al. (5), incorporated auxiliary systems such as optical character recognition, which introduced additional failure points that could reduce the study’s accuracy. The workflow assessed may differ even when the same AI platform was assessed in different studies. For example, both Alexander et al. (6) and Beck et al. (4) evaluated IBM’s Watson for Clinical Trial Matching (WCTM) system (IBM Corp, Armonk, NY). Yet, where Alexander et al. manually entered input parameters into WCTM, Beck et al. used WCTM’s natural language processing system to extract the input parameters from unstructured electronic health records. Hence, Alexander et al.’s study accuracy would be less affected by the performance of the WCTM natural language processing system than the study by Beck et al. Given such variations, summary statistics from meta-analyses become less insightful. What do the pooled metrics actually mean? Which enrollment step has the greatest implications for AI performance? Which AI algorithm is the best for each step? How do auxiliary systems such as optical character recognition affect the overall AI system’s performance? These are important questions that were overlooked in Chow et al.’s (2) review and require closer assessment in future reviews. Second, although the authors found that industry-developed systems exhibited higher positive predictive values than did in-house systems, they did not discuss the potential impact of conflict of interest on these findings. Industry sponsorship has been a historical sticking point in oncology research, with industry-funded studies more likely to yield positive outcomes and publish in high-impact journals (7). In Chow et al.’s review, studies assessing industry-developed systems all received industry funding, often from the very developers of the platforms under review (see Table 1). Many authors of these studies were also employed by the developers or hold stock options in the developers. Given that these preliminary studies are not registered as clinical trials, they are prone to biases. Hence, caution should be exercised when interpreting these results. Funding sources and conflict of interest of studies assessing the industry-developed systems included in the Chow et al. review Funding sources and conflict of interest of studies assessing the industry-developed systems included in the Chow et al. review In conclusion, although we share the authors’ belief in AI’s potential role in clinical trial enrollment, further investigations from nonindustry sources—with particular focus on each specific step of the AI enrollment process—would be needed to advance the field of AI applications in oncology trials. No data are reported in this correspondence. Jiawen Deng, MS-2 (Conceptualization; Investigation; Writing—original draft; Writing—review & editing), Kiyan Heybati, MS-3, MSc(c) (Investigation; Writing—review & editing). This correspondence and its authors received no funding support from any funding agency in the public, commercial, or not-for-profit sectors. The authors declare no conflicts of interest.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Étiquettes directes de modèles (non validées)

Étiquettes de catégorie et de devis d'étude par modèle, issues des rondes d'étiquetage. C'est une sortie machine, non validée, et le désaccord entre modèles est livré comme donnée. Aucun devis ici n'est encore validé contre MEDLINE.

BrasCatégoriesDevis d'étudeConfiance
gemmaaucune catégorie
Domaine: non disponible · Genre: Commentaire
Porte sur le système de recherche canadien: non · Porte sur un sujet canadien: non
Sans objetlow
gptaucune catégorie
Domaine: non disponible · Genre: Commentaire
Porte sur le système de recherche canadien: non · Porte sur un sujet canadien: non
Sans objethigh
modèles en accordL'accord compare des ensembles de catégories et des devis identiques entre les bras.

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,132
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,376
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,132
Score d'incertitude au seuil0,697

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1320,376
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,006
Bibliométrie0,0100,008
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0060,006
Science ouverte0,0050,004
Intégrité de la recherche0,0020,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0120,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,906
Tête enseignante GPT0,688
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Étiqueté directement par 2 modèles lisant le dossier complet.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJNCI Journal of the National Cancer InstituteMême sujetEthics in Clinical ResearchTravaux en français237 207