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Enregistrement W4388488683 · doi:10.1038/s41586-023-06717-x

Autoantibodies against type I IFNs in humans with alternative NF-κB pathway deficiency

2023· article· en· W4388488683 sur OpenAlexaff
Tom Le Voyer, Audrey V. Parent, Xian Liu, Axel Cederholm, Adrian Gervais, Jérémie Rosain, Tina Nguyen, Malena Pérez Lorenzo, Elze Rackaityte, Darawan Rinchai, Peng Zhang, Lucy Bizien, Gonca Hancıoğlu, Pascale Ghillani‐Dalbin, Jean‐Luc Charuel, Quentin Philippot, M Guèye, Majistor Raj Luxman Maglorius Renkilaraj, Masato Ogishi, Camille Soudée, Mélanie Migaud, Flore Rozenberg, Mana Momenilandi, Quentin Riller, Luisa Imberti, Ottavia M. Delmonte, Gabriele Müller, Baerbel Keller, Julio César Orrego, William Alexander Franco Gallego, Tamar Rubin, Melike Emiroğlu, Nima Parvaneh, Daniel Eriksson, Maribel Aranda‐Guillén, David I. Berrios, Linda Vong, Constance H. Katelaris, Peter Mustillo, Johannes Raedler, Jonathan Bohlen, Jale Bengi Çelik, Camila Astudillo, Sarah Winter, Stéphanie Boisson‐Dupuis, Éric Oksenhendler, Satoshi Okada, Oana Caluseriu, Mathilde Valeria Ursini, Éric Ballot, Geoffroy Lafarge, Tomáš Freiberger, Carlos A. Arango-Franco, Romain Lévy, Alessandro Aiuti, Saleh Al‐Muhsen, Fahd Al‐Mulla, Evangelos Andreakos, Andrés A. Arias, Hagit Baris Feldman, Paul Bastard, Анастасія Бондаренко, A. Borghesi, Ahmed Aziz Bousfiha, Petter Brodin, Yenan T. Bryceson, Giorgio Casari, John Christodoulou, Roger Colobrán, Antonio Condino-Neto, Jacques Fellay, Carlos Flores, José Luis Franco, Filomeen Haerynck, Rabih Halwani, Lennart Hammarström, James R. Heath, Elena W.Y. Hsieh, Yuval Itan, Elżbieta Kaja, Kai Kisand, Cheng‐Lung Ku, Yun Ling, YL Lau, Davood Mansouri, Isabelle Meyts, Joshua D. Milner, Trine H. Mogensen, Antonio Novelli, Giuseppe Novelli, Keisuke Okamoto, Tayfun Özçelık, Rebeca Pérez de Diego, Jordi Pérez‐Tur, David S. Perlin, Carolina Prando, Aurora Pujol, Lluís Quintana‐Murci, Laurent Rénia, Igor Resnick, Carlos Rodríguez‐Gallego, Vanessa Sancho‐Shimizu, Anna Šedivá, Mikko Seppänen, Mohammed Shahrooei, Anna Shcherbina, Pere Soler‐Palacín, Graziano Pesole, András N. Spaan, Helen C. Su, Ivan Tancevski, Ahmad Abou Tayoun, Ali Amara, Guy Gorochov, Şehime Gülsün Temel, Christian Thorball, Pierre Tiberghien, Sophie Trouillet‐Assant, Stuart E. Turvey, K. M. Furkan Uddin, Mohammed Uddin, Diederik van de Beek, Mateus Vidigal, Donald C. Vinh, Horst von Bernuth, Joost Wauters, Mayana Zatz, Shen‐Ying Zhang, Lisa F. P. Ng, Catriona McLean, Aurélien Guffroy, Joseph L. DeRisi, David Yu, Corey N. Miller, Yi Feng, Audrey Guichard, Vivien Béziat, Jacinta Bustamante, Qiang Pan‐Hammarström, Yu Zhang, Lindsey B. Rosen, Steven M. Holland, Marita Bosticardo, Heather Kenney, Riccardo Castagnoli, C Slade, Kaan Boztuğ, Nizar Mahlaoui, Sylvain Latour, Roshini S. Abraham, Vassilios Lougaris, Fabian Hauck, Faranaz Atschekzei, Georgios Sogkas, M. Cecilia Poli, Mary Slatter, Boaz Palterer, Michael D. Keller, Alberto Pinzón‐Charry, Anna Sullivan, Luke Droney, Daniel Suan, Melanie Wong, Alisa Kane, Hannah F. Hu, S. Cindy, Hana Grombiříková, Peter Čižnár, Ilan Dalal, Nathalie Aladjidi, Estibaliz Lazaro, Sevgi Keleş, Marion Malphettes, Marlène Pasquet, Maria Elena Maccari, Andrea Meinhardt, Aydan İkincioğulları, Mohammad Shahrooei, Fatih Çelmeli, Patrick Frosk, Christopher C. Goodnow, Paul Gray, Alexandre Bélot, Hye Sun Kuehn, Sergio D. Rosenzweig, Makoto Miyara, Francesco Licciardi, Amélie Servettaz, Vincent Barlogis, G. Le Guenno, Vera-Maria Herrmann, Taco W. Kuijpers, Grégoire Ducoux, F. Sarrot-Reynauld, Catharina Schuetz, Charlotte Cunningham‐Rundles, Frédéric Rieux‐Laucat, Stuart G. Tangye, Cristina Sobacchi, Rainer Döffinger, Klaus Warnatz, Bodo Grimbacher, Claire Fieschi, Laureline Berteloot, Vanessa L. Bryant, Bénédicte Neven, Laurent Abel, Qian Zhang, Bertrand Boisson, Aurélie Cobat, Emmanuelle Jouanguy, Olle Kämpe, Chaim M. Roifman, Nils Landegren, Luigi D. Notarangelo, Mark S. Anderson, Jean‐Laurent Casanova, Anne Puel

Notice bibliographique

RevueNature · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Cell Function and Interaction
Établissements canadiensMcGill University Health CentreGenome CanadaWomen and Children’s Health Research InstituteUniversity of AlbertaUniversity of British ColumbiaHospital for Sick ChildrenBC Children's HospitalUniversity of TorontoSickKids FoundationUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNational Center for Advancing Translational SciencesMedical Research CouncilHonjo International Scholarship FoundationScience for Life LaboratoryGeorgia Clinical and Translational Science AllianceVetenskapsrådetKnut och Alice Wallenbergs StiftelseEuropean CommissionAssistance Publique - Hôpitaux de ParisBundesministerium für Bildung und ForschungNational Health and Medical Research CouncilElse Kröner-Fresenius-StiftungInstitut des maladies génétiques ImagineGöran Gustafssons StiftelserMinistère de l'Enseignement supérieur, de la Recherche et de l'InnovationFondation pour la Recherche MédicaleNHLBI Division of Intramural ResearchDeutsches Zentrum für InfektionsforschungInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleNational Institute on AgingDivision of Intramural Research, National Institute of Allergy and Infectious DiseasesFondation du SouffleNational Institutes of HealthNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesFisher Center for Alzheimer's Research FoundationAgence Nationale de la RechercheJeffrey Modell Foundation
Mots-clésAutoantibodyImmunologyBiologyNF-κBType (biology)MedicineCancer researchAntibodyInflammationEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Patients with autoimmune polyendocrinopathy syndrome type 1 (APS-1) caused by autosomal recessive AIRE deficiency produce autoantibodies that neutralize type I interferons (IFNs) 1,2 , conferring a predisposition to life-threatening COVID-19 pneumonia 3 . Here we report that patients with autosomal recessive NIK or RELB deficiency, or a specific type of autosomal-dominant NF-κB2 deficiency, also have neutralizing autoantibodies against type I IFNs and are at higher risk of getting life-threatening COVID-19 pneumonia. In patients with autosomal-dominant NF-κB2 deficiency, these autoantibodies are found only in individuals who are heterozygous for variants associated with both transcription (p52 activity) loss of function (LOF) due to impaired p100 processing to generate p52, and regulatory (IκBδ activity) gain of function (GOF) due to the accumulation of unprocessed p100, therefore increasing the inhibitory activity of IκBδ (hereafter, p52 LOF /IκBδ GOF ). By contrast, neutralizing autoantibodies against type I IFNs are not found in individuals who are heterozygous for NFKB2 variants causing haploinsufficiency of p100 and p52 (hereafter, p52 LOF /IκBδ LOF ) or gain-of-function of p52 (hereafter, p52 GOF /IκBδ LOF ). In contrast to patients with APS-1, patients with disorders of NIK, RELB or NF-κB2 have very few tissue-specific autoantibodies. However, their thymuses have an abnormal structure, with few AIRE-expressing medullary thymic epithelial cells. Human inborn errors of the alternative NF-κB pathway impair the development of AIRE-expressing medullary thymic epithelial cells, thereby underlying the production of autoantibodies against type I IFNs and predisposition to viral diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,632
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations105
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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