MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4388567714 · doi:10.3390/biomedicines11113017

The Ultraviolet Irradiation of Keratinocytes Induces Ectopic Expression of LINE-1 Retrotransposon Machinery and Leads to Cellular Senescence

2023· article· en· W4388567714 sur OpenAlexafffund
Fadi Touma, Marine Lambert, Amelia Martínez Villarreal, Jennifer Gantchev, Brandon Ramchatesingh, Ivan V. Litvinov

Notice bibliographique

RevueBiomedicines · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueChromosomal and Genetic Variations
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéCanadian Institutes of Health ResearchCancer Research Society
Mots-clésHaCaTGenome instabilityEctopic expressionRetrotransposonSenescenceKeratinocyteDownregulation and upregulationBiologyDNA damageCell culturePhotoagingCell biologyMolecular biologyTransfectionCancer researchGeneticsDNAGeneTransposable element

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Retrotransposons have played an important role in evolution through their transposable activity. The largest and the only currently active human group of mobile DNAs are the LINE-1 retrotransposons. The ectopic expression of LINE-1 has been correlated with genomic instability. Narrow-band ultraviolet B (NB-UVB) and broad-band ultraviolet B (BB-UVB) phototherapy is commonly used for the treatment of dermatological diseases. UVB exposure is carcinogenic and can lead, in keratinocytes, to genomic instability. We hypothesize that LINE-1 reactivation occurs at a high rate in response to UVB exposure on the skin, which significantly contributes to genomic instability and DNA damage leading to cellular senescence and photoaging. Immortalized N/TERT1 and HaCaT human keratinocyte cell lines were irradiated in vitro with either NB-UVB or BB-UVB. Using immunofluorescence and Western blotting, we confirmed UVB-induced protein expression of LINE-1. Using RT-qPCR, we measured the mRNA expression of LINE-1 and senescence markers that were upregulated after several NB-UVB exposures. Selected miRNAs that are known to bind LINE-1 mRNA were measured using RT-qPCR, and the expression of miR-16 was downregulated with UVB exposure. Our findings demonstrate that UVB irradiation induces LINE-1 reactivation and DNA damage in normal keratinocytes along with the associated upregulation of cellular senescence markers and change in miR-16 expression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,551
Score d'incertitude au seuil0,086

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBiomedicinesMême sujetChromosomal and Genetic VariationsTravaux en français237 207