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Enregistrement W4388588556 · doi:10.1093/neuonc/noad179.0479

EPCO-16. DISRUPTING DOT1L EPIGENETIC ACTIVITY REPROGRAMS GLIOBLASTOMA STEM CELLS TOWARDS A DOPAMINERGIC NEURONAL-LIKE STATE

2023· article· en· W4388588556 sur OpenAlexaff
Samir Assaf, Danielle Bozek, H. Artee Luchman, Samuel Weiss

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensInstitute of Neurosciences, Mental Health and AddictionGovernment of CanadaUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEpigeneticsBiologyChromatinNeural stem cellTranscription factorStem cellEpigenetic regulation of neurogenesisEpigenomicsEmbryonic stem cellGene silencingRegulation of gene expressionNeuroscienceGene expressionGeneticsCancer researchCell biologyDNA methylationChromatin remodelingGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Glioblastoma is the most common and aggressive primary adult brain tumor, remaining incurable despite current therapeutic strategies. Through a genome-wide essentiality screen, we previously identified disruptor of telomeric silencing-1-like (DOT1L) as one of the most important epigenetic regulators in glioblastoma stem cells (GSCs). Chemogenic inhibition of DOT1L epigenetic activity was found to increase the expression of neuronal markers while decreasing the expression of cancer stem cell markers at the transcriptional and protein level, suggesting GSC differentiation towards a neuronal lineage. Thus, we sought to investigate the mechanism of DOT1L in GSCs and whether disruption of DOT1L epigenetic activity promotes functional integration of GSCs into neural circuits. Here, we profiled the overall transcriptional and chromatin accessibility landscape of GSCs following DOT1L inhibition. Interestingly, we identified that DOT1L inhibition results in increased chromatin accessibility at key gene loci involved in neural differentiation, synaptic transmission, in addition to dopamine synthesis, packaging, and release, which correlated with upregulated gene expression. Furthermore, these gene loci exhibited alterations of the DOT1L epigenetic mark, H3K79me2. Transcriptional motif analysis of GSCs following DOT1L inhibition revealed dysregulated accessibility of transcription factor motifs known to be involved in regulating cellular response to neuronal signals. Cell viability assessment of GSCs treated with a DOT1L inhibitor and a panel of neurotransmitters further confirmed that DOT1L inhibition sensitizes GSCs to neuronal signals. These data suggest that disrupting the epigenetic activity of DOT1L reprograms the epigenetic landscape of GSCs to promote a functional, dopaminergic, neuronal-like state that exhibits enhanced responsiveness to neuronal signals. Future experiments aim to investigate the impact of disrupted DOT1L epigenetic activity on GSC-neuronal bidirectional communication and the mechanisms by which this influences the progression and aggressiveness of glioblastoma.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,295
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
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Résumé présentoui

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