MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4388694739 · doi:10.1080/07060661.2023.2276224

Differential occurrence and strain composition of potato viruses between two major seed potato production zones in China suggest the need for different management strategies for the zones

2023· article· en· W4388694739 sur OpenAlexaffvenue
Yanling Gao, Guoquan Fan, Shengqun Cheng, Wei Zhang, Shen Yu, Shu Zhang, Cailing Qiu, Xianzhou Nie, Yanju Bai, Wenhe Lu

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Pathology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Virus Research Studies
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPotato virus YBiologyVirologyStrain (injury)Plant virusVirusAlfalfa mosaic virusPotato virus XHorticultureAgronomyVeterinary medicineGeneRNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Viral disease is one of the major reasons leading to yield and quality reduction of potato production. To gain better knowledge about seed potato quality in China, the occurrences of six common viruses, including potato leafroll virus (PLRV) and potato viruses A (PVA), M (PVM), S (PVS), X (PVX) and Y (PVY), were investigated in two of China’s four potato production zones (specifically, Zone I and Zone IV) from 2013 to 2016. A total of 1231 random tuber samples (Zone I, n = 571; Zone IV, n = 660) and 532 symptomatic leaf samples (Zone I, n = 375; Zone IV, n = 157) were collected in seed potato and commercial potato fields and tested for the viruses by reverse transcription (RT)-PCR (tuber samples) and/or enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA; leaf samples). The results showed that virus-free tubers accounted for 79.7% and 52.0% in seed tuber samples from zones I and IV, respectively. All of the six viruses analysed were present in both zones I and IV, but occurred at different frequencies, with PVY and PVS being the predominant viruses in zones I and IV, respectively. Moreover, 44.0% and 39.8% of the virus-positive samples in zones I and IV, respectively, were found to be infected with more than one virus. Strain typing of PVS and PVY demonstrated the existence of similar strains of PVY (i.e. PVYO, PVYNTNb, PVYN:O, PVYN-Wi, PVY – (SYR-I and -II) and of PVS (i.e. PVSO and PVSA) in both zones. For PVY, recombinant strains were predominant, with SYR-II (27.7%) being the most abundant strain in Zone I and SYR-I (53.3%) being the predominant strain in Zone IV. PVSO was the predominant strain in Zone I whereas PVSA was the dominant strain in Zone IV. This study revealed not only the high incidence of viruses in both seed and commercial potatoes in China, but also the differential occurrence and strain composition of the viruses between two major production zones in China for the first time. In addition, the study suggests the need for different management strategies for different production zones to enhance the quality of seed potatoes in China.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,022
Score d'incertitude au seuil0,044

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCanadian Journal of Plant PathologyMême sujetPlant Virus Research StudiesTravaux en français237 207