Structural and functional characterization of sugarcane SnRK2 kinases
Notice bibliographique
Résumé
A disponibilidade de água é um dos principais fatores que influenciam o desenvolvimento e a sobrevivência das plantas.A capacidade das plantas para enfrentar o estresse hídrico é um elemento-chave no seu ciclo de vida e o ácido abscísico (ABA) tem um papel essencial nas respostas a esse e outros estresses abióticos.As quinases SnRK2 (proteínas quinases relacionadas a SNF1) são ativadoras centrais da via de resposta ABA e desencadeiam a resposta ao hormônio por meio de uma cascata de eventos de fosforilação, iniciada com a auto-ativação da quinase.A sinalização intracelular do ABA, bem como a regulação e estrutura das SnRK2s, tem sido amplamente estudada em Arabidopsis thaliana.No entanto, a estrutura e bioquímica dessas proteínas permanecem pouco exploradas em plantas cultivadas, como no caso da cana-de-açúcar.Nesta tese, identificamos as quinases SnRK2 de cana-deaçúcar e estudamos em profundidade sua estrutura, autorregulação e atividade.Surpreendentemente, apesar da alta similaridade entre as estruturas cristalográficas das SnRK2s de cana-de-açúcar e Arabidopsis, nossos estudos de mutagênese indicam que as proteínas apresentam diferenças na sua regulação bioquímica.Além disso, sugerimos um papel diferente para um domínio regulatório da quinase anteriormente relacionado à sua desfosforilação.Além das SnRK2s, focamos no crosstalk entre as vias do ABA e do ácido giberélico (GA), hormônio promotor de crescimento e que apresenta uma interação antagônica com ABA em vários estágios de desenvolvimento da planta.Nesta tese, hipotetizamos que as SnRK2s quinases e as proteínas DELLA -principais repressoras da resposta ao GA -podem ter um papel no conhecido antagonismo entre ABA-GA.Nossas análises, utilizando proteínas de cana e Arabidopsis, demonstraram que SnRK2s e DELLAs são capazes de interagir em leveduras e in planta.Além disso, as SnRK2s de cana foram capazes de fosforilar DELLA in vitro.Essas observações sugerem que SnRK2s e DELLA podem ter um papel no crosstalk entre ABA-GA, possivelmente por meio da fosforilação.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».