Structural and functional characterization of sugarcane SnRK2 kinases
Bibliographic record
Abstract
A disponibilidade de água é um dos principais fatores que influenciam o desenvolvimento e a sobrevivência das plantas.A capacidade das plantas para enfrentar o estresse hídrico é um elemento-chave no seu ciclo de vida e o ácido abscísico (ABA) tem um papel essencial nas respostas a esse e outros estresses abióticos.As quinases SnRK2 (proteínas quinases relacionadas a SNF1) são ativadoras centrais da via de resposta ABA e desencadeiam a resposta ao hormônio por meio de uma cascata de eventos de fosforilação, iniciada com a auto-ativação da quinase.A sinalização intracelular do ABA, bem como a regulação e estrutura das SnRK2s, tem sido amplamente estudada em Arabidopsis thaliana.No entanto, a estrutura e bioquímica dessas proteínas permanecem pouco exploradas em plantas cultivadas, como no caso da cana-de-açúcar.Nesta tese, identificamos as quinases SnRK2 de cana-deaçúcar e estudamos em profundidade sua estrutura, autorregulação e atividade.Surpreendentemente, apesar da alta similaridade entre as estruturas cristalográficas das SnRK2s de cana-de-açúcar e Arabidopsis, nossos estudos de mutagênese indicam que as proteínas apresentam diferenças na sua regulação bioquímica.Além disso, sugerimos um papel diferente para um domínio regulatório da quinase anteriormente relacionado à sua desfosforilação.Além das SnRK2s, focamos no crosstalk entre as vias do ABA e do ácido giberélico (GA), hormônio promotor de crescimento e que apresenta uma interação antagônica com ABA em vários estágios de desenvolvimento da planta.Nesta tese, hipotetizamos que as SnRK2s quinases e as proteínas DELLA -principais repressoras da resposta ao GA -podem ter um papel no conhecido antagonismo entre ABA-GA.Nossas análises, utilizando proteínas de cana e Arabidopsis, demonstraram que SnRK2s e DELLAs são capazes de interagir em leveduras e in planta.Além disso, as SnRK2s de cana foram capazes de fosforilar DELLA in vitro.Essas observações sugerem que SnRK2s e DELLA podem ter um papel no crosstalk entre ABA-GA, possivelmente por meio da fosforilação.
Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.
How this classification was reachedexpand
Full frame machine prediction
Teacher imitationNot calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.
Distilled classifier scores by category (both heads)
| Category | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Metaresearch | 0.000 | 0.000 |
| Meta-epidemiology (narrow) | 0.000 | 0.000 |
| Meta-epidemiology (broad) | 0.000 | 0.000 |
| Bibliometrics | 0.000 | 0.000 |
| Science and technology studies | 0.000 | 0.000 |
| Scholarly communication | 0.000 | 0.000 |
| Open science | 0.000 | 0.000 |
| Research integrity | 0.000 | 0.000 |
| Insufficient payload (model declined to judge) | 0.001 | 0.000 |
Machine scores (provisional)
The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.
Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.
score_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from itClassification
machine, unvalidatedMachine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.
How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".