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Enregistrement W4388870585 · doi:10.3201/eid2912.230373

Naturally Acquired Rabies in White-Eared Opossum, Brazil

2023· article· en· W4388870585 sur OpenAlexaff
Eduardo Ferreira‐Machado, Juliana Amorim Conselheiro, Bruno Emerson Bernardes da Silva, Patrícia Sayuri Silvestre Matsumoto, C. Castagna, Aline Nitsche, Celino Simão de Lima, Douglas Presotto, Madelline Christie Rodrigues Nunes da Silva, Ticiana Brasil Ervedosa, Pedro Enrique Navas‐Suárez, Ísis Paixão de Jesus, Júlia de Carvalho, Rodrigo Albergaria Réssio, Cinthya dos Santos Cirqueira, Gisely Toledo Barone, Leilla del Castillo Saad, Paulo Eduardo Brandão, José Luiz Catão‐Dias, Juliana Mariotti Guerra, Natália Coelho Couto de Azevedo Fernandes

Notice bibliographique

RevueEmerging infectious diseases · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueRabies epidemiology and control
Établissements canadiensWiLAN (Canada)
Organismes subventionnairesConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo
Mots-clésRabiesOpossumGeographyWildlifeDisease reservoirBiologyZoologyVirologyEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

R abies is a viral zoonosis with high mortality rates caused by Lyssavirus rabies lineages (rabies virus, RABV) (1).Opossums of the genus Didelphis are marsupials widely distributed in the Americas, synanthropic in urban scenarios, and considered resistant to RABV (2).The main urban reservoirs of RABV in Brazil are nonhematophagous bats with distinct lineages and epidemiologic aspects (3).In 2021, passive surveillance programs detected an unusual case of rabies in a white-eared opossum (D. albiventris) by a RABV lineage of frugivorous bats of genus Artibeus spp. in Campinas, São Paulo state, Brazil, the 10th most urbanized city in the country (4).To elucidate the dynamics of this spillover, we describe the results of passive surveillance for rabies in bats and opossums in Campinas in 2021. The StudyIn 2021, we tested samples of frozen brain tissue from 930 bats and 22 opossums for rabies by direct fluorescent antibody test and confirmed infection by virus isolation in cell culture (5) in Campinas.Fixed formalin brain tissue fragments in 15 of these 22 opossums were analyzed by histopathology.In addition, for the opossum that tested positive for rabies, we performed reverse transcription PCR and subsequent phylogenetic analysis of the glycoprotein gene of RABV in the frozen brain tissue and conducted immunohistochemical analysis for rabies in fixed formalin tissues (cerebrum, cerebellum, heart, lungs, liver, spleen, kidney, and adrenal glands) (Appendix 1, https://wwwnc.cdc.gov/EID/article/29/12/23-0373-App1.pdf;Appendix 2, https://wwwnc.cdc.gov/EID/article/29/12/23-0373-App2.xlsx

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,069
Score d'incertitude au seuil0,137

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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