Deciphering MMP9’s dual role in regulating SOD3 through protein–protein interactions
Notice bibliographique
Résumé
Although the collagenase enzyme activity of matrix metalloproteinase-9 (MMP9) is well-documented, its non-enzymatic functions remain less understood. The interaction between intracellular superoxide dismutase-1 (SOD1) and MMP9 is known, with SOD1 suppressing MMP9. However, the mechanism by which MMP9, a secretory protein, influences the extracellular antioxidant superoxide dismutase-3 (SOD3) is not yet clear. To explore MMP9's regulatory impact on SOD3, we employed human embryonic kidney-293 cells, transfecting them with MMP9 overexpresssion and catalytic-site mutant plasmids. Additionally, MMP9 overexpressing cells were treated with an MMP9 activator and inhibitor. Analyses of both cell lysates and culture medium provided insights into MMP9's intracellular and extracellular regulatory roles. In-silico analysis and experimental approaches like proximal ligation assay and co-immunoprecipitation were utilized to delineate the protein-protein interactions between MMP9 and SOD3. Our findings indicate that activated MMP9 enhances SOD3 levels, a regulation not hindered by MMP9 inhibitors. Intriguingly, catalytically inactive MMP9 appeared to reduce SOD3 levels, likely due to MMP9's binding with SOD3, leading to their proteolytic degradation. This MMP9 influence on SOD3 was consistent in both intracellular and extracellular environments, suggesting a parallel in MMP9-SOD3 interactions across these domains. Ultimately, this study unveils a novel interaction between MMP9 and SOD3, highlighting the unique regulatory role of catalytically inactive MMP9 in diminishing SOD3 levels, contrasting its usual upregulation by active MMP9.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».