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Enregistrement W4389019695 · doi:10.1096/fasebj.31.1_supplement.741.1

Identification and Characterization of Bacterial and Host Factors Involved in Microtubule Disassembly in Epithelial Cells during <i>Edwardsiella</i> Infections

2017· article· en· W4389019695 sur OpenAlexaffabout
Priyanka Aggarwal, Qiyao Wang, Qin Liu, Ka Yin Leung, Julian A. Guttman

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAquaculture disease management and microbiota
Établissements canadiensTrinity Western UniversityWestern UniversitySimon Fraser University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMicrotubuleBiologyMicrobiologyCytoskeletonCell biologyProtein subunitGeneCellGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Enteric bacteria from the genus Edwardsiella cause great losses to a variety of commercially important fish such as the Japanese Eel, Channel Catfish and Turbot. In humans, they cause a gastroenteritis‐like phenotype. These bacteria are known to infect both inflammatory and epithelial cells. Although macrophages are by far the best‐studied cell types during these infections, epithelial cell studies have lagged primarily due to poor infection models. Because these bacteria resemble other intestinal pathogens and because the host cytoskeleton is a common target of intestinal pathogens, we hypothesized that similar infections could be established to evaluate host actin, intermediate filament and microtubule alterations. Here we established two different epithelial cell infections using HeLa and CaCo‐2 cells and demonstrate that only the microtubule cytoskeleton is noticeably altered by these bacteria. We found that microtubules are initially severed then completely disassembled during Edwardsiella infections . To identify the bacterial and host components involved in this phenotype, we screened a 2,758 mutant Edwardsiella genome transposon insertion library and localized all known host microtubule‐severing enzymes (katanin, spastin, and fidgetin). Using the screening approach we were able to narrow the 2,758 Edwardsiella mutants/genes to 15 that are key players in causing MT disassembly in epithelial cells. Immunolocalization experiments showed the katanin subunit A‐like 1, katanin subunit B 1, and katanin subunit B‐like 1 at microtubule cut sites, suggesting their involvement in the microtubule disassembly event. This work not only provides the first evidence of host cytoskeletal alterations during Edwardsiella infections, but also provides a resource for further characterization of molecular components involved in microtubule disassembly in general. Support or Funding Information Funding source: Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada (NSERC)and SFU BISC department funds

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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