MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4389020211 · doi:10.1096/fasebj.31.1_supplement.778.3

Leigh Syndrome French Canadian Type Patient Fibroblasts Exhibit Energy Metabolism Adaptations Through a Warburg‐like Effect

2017· article· en· W4389020211 sur OpenAlexaffabout
Yvette Mukaneza, Aarón Cohen, Marie-Ève Rivard, Jessica Tardif, Catherine Laprise, Christine Des Rosiers, Lise Coderre

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMitochondrial Function and Pathology
Établissements canadiensUniversité du Québec à ChicoutimiUniversité de MontréalMontreal Heart Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGlycolysismTORC1Oxidative phosphorylationMitochondrionWarburg effectProtein kinase BCitric acid cyclePyruvate dehydrogenase complexBiologyPyruvate decarboxylationPI3K/AKT/mTOR pathwayCytochrome c oxidaseCell biologyChemistryPhosphorylationBiochemistryMetabolismSignal transductionEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background & Objective LSFC is a recessive mitochondrial disease caused by mutations in the LRPPRC gene resulting in a decrease in the LRPPRC protein. This leads to a tissue‐specific reduction of complex IV or cytochrome c oxidase (COX). Our previous work in LSFC fibroblasts demonstrated several mitochondrial functional abnormalities including reduced mitochondrial membrane potential, fragmentation of the mitochondrial network and impaired oxidative phosphorylation capacity. Despite these abnormalities, LSFC fibroblasts did not display any reduction in ATP levels, suggesting the activation of compensatory mechanisms. We hypothesized that mTORC1‐mediated glycolytic ATP production, also known as Warburg effect, might compensate for mitochondrial dysfunction. To address this question, we evaluated glycolytic flux and the Akt/mTORC1 signaling pathway, using LSFC and control skin fibroblasts as a model. Results Our results showed numerous adaptations of LSFC energy metabolism. Metabolic flux analysis revealed that glucose contribution to pyruvate, lactate and alanine formation was respectively increased by 41%, 61%, and 52% (p≤0.05) in LSFC fibroblasts compared to controls. At the molecular level, the Akt/mTORC1 pathway was up regulated in LSFC cells compared to controls (pAkt 111%, p≤0.05; Akt 44%, p≤0.001; mTOR 51%, p≤0.01). This includes enhanced phosphorylation of mTORC1 downstream targets p70S6K by 105% (p≤0.05); as well as an increase in the expression of the transcription factor HIF‐1α by 200% (p≤0.01). The level of pyruvate dehydrogenase kinase 1 (PDHK1), a HIF‐1α downstream target and an inhibitor of mitochondrial glucose oxidation via pyruvate dehydrogenase 1 (PDH1) phosphorylation, was also up regulated by 150% (p≤0.05) in LSFC cells. Consistent with these results, we observed an increase of PDH1 phosphorylation by 94% (p≤0.01) in LSFC cells compared to controls. To further delineate the role of mTORC1 pathway in these adaptations, we inhibited its activity with rapamycin. mTORC1 inhibition did not affect HIF‐1α or PDHK1 expression. However, rapamycin was associated with increased PDH1 phosphorylation (p≤0.05) by 37% and 42% in LSFC and control fibroblasts, respectively. Rapamycin also reduced ATP levels by 8% (p=0.07) in LSFC fibroblasts comparatively to 15% (p≤0.05) in controls. Interestingly, rapamycin decreased LRPPRC expression by 41% (p≤0.01) in LSFC cells compared to only 11% (p≤0.05) reduction in control. This was associated with a selective reduction of COX expression in LSFC (32%, p≤0.01) fibroblasts, while we did not observe any change in expression of the others mitochondrial complexes. Conclusion LSFC fibroblasts maintain ATP levels probably through a “Warburg‐like effect”; for which mTORC1 is not the primary regulator. mTORC1 activation, however, appears important for LRPPRC and therefore, COX expression in LSFC fibroblasts. Support or Funding Information Supported by: Association de l'acidose lactique and CIHR Emerging Team Grant

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,054
Score d'incertitude au seuil0,107

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe FASEB Journal→Même sujetMitochondrial Function and Pathology→Travaux en français237 207→