Cobalamin‐deficiency results in altered partitioning of mitochondrial one‐carbon units to formate
Notice bibliographique
Résumé
Vitamin B 12 , a co‐factor for methionine synthase, plays an important role in folate‐dependent remethylation of homocysteine. We have shown that cobalamin deficiency results in a marked elevation in plasma formate. De novo production of formate in rats was determined as described by Morrow et al (JBC 2015). Formate production from one‐carbon precursors by isolated rat liver mitochondria was measured by GC‐MS. 14 CO 2 production from 3‐[ 14 C]‐serine by isolated rat liver mitochondria, expression of key genes (RT‐qPCR) and changes in protein expression (immunoblot) were also determined. Vitamin B 12 ‐deficient rats (B 12 ‐def) showed a 55% increase in endogenous formate production, consistent with the elevated formate levels. Formate production by isolated mitochondria from serine, dimethylglycine, and sarcosine was increased by at least 60% in B 12 ‐def animals while 14 CO 2 production from serine by these mitochondria was 26% lower compared to replete controls. The expression of Mthfd1l in B 12 ‐def animals was unchanged but the expression of Aldh1l1 and Aldh1l2 was reduced by 40–60% of that in the livers of control animals. We suggest that the partitioning of mitochondrial formyl‐THF between oxidation to CO 2 (by ALDH1L2) and production of free formate (by MTHFD1L) is a key control point in one‐carbon metabolism. In B 12 ‐def the decreased flux through ALDH1L2, in the face of a constant rate of 10‐formyl‐THF disposition can explain the increased production and increased concentration of formate. We speculate that the decreased hepatic SAM levels found in B 12 ‐def animals may cause increased production of one‐carbon groups in the form of formate to replenish hepatic SAM. Since mitochondrial formate becomes available to the cytosol we suggest that this metabolic bifurcation may regulate the entry of formate into the cytosolic one‐carbon pool. Support or Funding Information Supported by CIHR, RDC, and Memorial University of Newfoundland
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».