<i>LCT</i> Gene Variant (−13910C>T) and the Plasma Proteome: A Mendelian Randomization Study
Notice bibliographique
Résumé
Background The impact of dairy consumptions on risk of cardiometabolic disease remains controversial. Individuals with lactose intolerance (LI) tend to avoid dairy, which is rich in lactose. The LCT −13910C>T variant has been associated with LI and dairy intake in European populations. Mendelian randomization is an approach that examines the association between an exposure and an outcome using a gene variant that is robustly associated with the exposure. The objective of this study was to determine the association between dairy consumption and 54‐plasma proteins implicated in the development of various chronic diseases using the Mendelian randomization approach. Methods Fasting blood samples were drawn from a total of 508 non‐smoking Caucasians aged 20–29 years from the Toronto Nutrigenomics and Health Study for genotyping of the −13910C>T variant in the LCT gene. Fifty‐four plasma proteins were analyzed using liquid chromatography/multiple‐reaction‐monitoring mass spectrometry. Dairy intake was assessed using a one‐month, 196‐item food frequency questionnaire. Using the instrumental variable analysis, a Mendelian randomization approach was applied to examine the association between LCT genotypes and 54‐plasma proteins. Results The CC genotype, associated with lactose intolerance, was associated with higher levels of circulating fibrinogen alpha chain (p= 0.02) compared to the TT genotype. This association was due, at least in part, to lower total dairy intake (p=0.002), particularly skim milk in this population (p=0.004). Conclusion The LCT genotype that associated with LI is associated with higher levels of fibrinogen alpha chain, which suggests that dairy intake might be associated with a reduced risk of thrombosis. Support or Funding Information King Abdulaziz University
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,008 | 0,019 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».