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Enregistrement W4389023472 · doi:10.1096/fasebj.30.1_supplement.1144.1

Structural and Dynamical Basis of the Cross Talk between cAMP and cGMP Signaling Pathways

2016· article· en· W4389023472 sur OpenAlexafffundabout
Giuseppe Melacini, Bryan VanSchouwen

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePhosphodiesterase function and regulation
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésCyclic nucleotideSecond messenger systemPotencycGMP-dependent protein kinaseSignal transductionProtein kinase APDE10AChemistryGuanine nucleotide exchange factorKinaseNucleotideIntracellularCell biologyBiochemistryBiologyPhosphodiesteraseGeneIn vitroEnzymeMitogen-activated protein kinase kinase

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Protein kinases A and G (PKA and PKG) are respectively activated by the cAMP and cGMP second messengers and regulate signaling pathways that are often distinct. Nevertheless, due to the typically higher intracellular concentrations of cAMP vs. cGMP, cAMP contributes to the partial activation of PKG and to the modulation of the cGMP‐dependence of PKG activity, resulting in cAMP vs. cGMP signaling cross talk. However, the structural and dynamical basis for such cAMP vs. cGMP cross regulation is only limitedly understood. While it is known that the partial activation of PKG by cAMP arises from a combination of reduced cAMP vs. cGMP affinity (potency) and activation (efficacy) [1], the contributions of different functional groups in the cyclic nucleotide bases to such variations in potency and efficacy have not been fully dissected. Here, we show how the distinct contributions to potency and efficacy of the carbonyl at position 6 and the amino at position 2 of the guanine base are dissected by mapping through NMR [2–8] the interactions of a library of cyclic‐nucleotides with the C‐terminal cyclic nucleotide‐binding domain (CNB) of PKG, which is primarily responsible for the selective activation of PKG by cGMP. A model is proposed to explain the non‐additive contributions of these two functional groups to the potency and efficacy of PKG activation, providing insight into the molecular basis of cAMP vs. cGMP signaling cross talk. Support or Funding Information This work was supported by Grant (MOP‐68897) from the Canadian Institutes of Health Research (to G. M.). The authors declare that they have no conflicts of interest with the contents of this article.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,145
Score d'incertitude au seuil0,150

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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