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Enregistrement W4389023650 · doi:10.1096/fasebj.31.1_supplement.1078.5

Regulation of Twist1 and Snail1 Gene Expression in Cardiac Fibroblasts by Scleraxis

2017· article· en· W4389023650 sur OpenAlexafffundabout
Hamza A. Safi, Danah S. Al‐Hattab, Raghu S. Nagalingam, Michael P. Czubryt

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTissue Engineering and Regenerative Medicine
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésTranscription factorCell biologyEpithelial–mesenchymal transitionPromoterBiologyMyofibroblastCardiac fibrosisRegulation of gene expressionGene expressionFibrosisCancer researchGeneGeneticsDownregulation and upregulationMedicinePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cardiac fibrosis causes progressive cardiac stiffening due to abnormal deposition of extracellular matrix (ECM) and alters electrical conduction of the action potential, resulting in heart failure and death. Cardiac fibroblasts largely arise from epithelial precursors during development via epithelial‐to‐mesenchymal transition (EMT), and upon injury or stress, are further converted to an activated state – myofibroblasts – which express a variety of pro‐fibrotic genes responsible for ECM synthesis and deposition. Our previous data suggested that the transcription factor scleraxis plays a key role in regulating cardiac fibroblast cell fate, including EMT and myofibroblast conversion. Here, we examined the role of scleraxis in transactivating expression of genes encoding key EMT regulators including the basic helix‐loop‐helix transcription factor Twist1 and the zinc finger transcription factor Snail1. Over‐expression of scleraxis in NIH3T3 fibroblasts up‐regulated Twist1 and Snail1 expression. Using luciferase reporter assays coupled with point mutagenesis, we found that scleraxis is sufficient to directly transactivate the Twist1 and Snail1 gene promoters, and identified the responsible scleraxis binding sites in each promoter. Loss of scleraxis conversely attenuated expression of these genes. Together, our data indicates that scleraxis controls EMT via direct upstream regulation of these key EMT regulatory genes. Support or Funding Information Supported by the Canadian Institutes of Health Research (MOP136862 to MPC), Research Manitoba (RSN) and the University of Manitoba GETS Program (HAS, DSA, RSN).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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