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Enregistrement W4389024517 · doi:10.1096/fasebj.30.1_supplement.802.8

Human growth gene family chromosomal architecture is affected by maternal obesity, gestational diabetes and insulin treatment

2016· article· en· W4389024517 sur OpenAlexafffundabout
Yan Jin, Hana Vakili, Savas Menticoglou, Peter A. Cattini

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Syndromes and Imprinting
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésEndocrinologyInternal medicineBiologyInsulin resistanceLocus (genetics)ChromatinGestational diabetesChromatin immunoprecipitationGeneGene expressionInsulinPromoterPregnancyGeneticsGestationMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Human placental chorionic somatomammotropin (CS) ‐A and B, and growth hormone variant (GH‐V) are placental members of the human (h) growth hormone (GH) gene family. These genes are located at a single locus on chromosome 17 in tandem with the pituitary hGH gene (GH‐N). CS and GH‐V stimulate pancreatic β‐cells in the response to ‘normal’ pregnancy induced insulin resistance. Maternal obesity exacerbates this ‘resistance’ and decreases CS/GH‐V gene expression, increasing the risk for gestational diabetes (GDM). Looping together of hGH‐N promoter and remote (14.5–32 kilobases) upstream hGH/CS locus control region (LCR) sequences is essential for efficient gene expression in vivo . Recently, hGH‐N chromatin looping and gene expression were shown to be negatively affected by excess caloric intake. Thus, we have compared the effect of maternal obesity (BMI >35 kg/m 2 ) without or with the further complication of GDM and insulin treatment on the chromatin structure and expression of the hCS/GH‐V gene locus in pregnancy. Human CS‐A RNA was decreased with maternal obesity but increased to levels detected in placentas from obese women with insulin treatment. Chromatin conformation capture (3C) assay was used to assess the long‐range interaction between the remote LCR sequences that include three nuclease hypersensitive sites (HS III–V) in human placental syncytiotrophoblasts, with and more proximal regulatory sequences linked to CS/GH‐V gene expression. Recruitment of RNA polymerase II at the promoter regions was also assessed as an indication of transcriptional status by chromatin immunoprecipitation assay. Physical interactions between remote LCR and local regulatory regions of the CS genes, suggesting looping of intervening sequences, were detected in lean woman, but were disrupted by maternal obesity. The same disrupted chromosomal conformation was not seen in obese diabetic pregnant women treated with insulin. However, although evidence of chromatin looping involving LCR and local regulatory sequences was apparent, the pattern was distinct when compared to lean placental samples. Maternal obesity was associated with significant decreases in RNA polymerase II occupancy at the promoter regions. Insulin treatment in obese women with a diabetic condition, however, significantly muted the decrease in RNA polymerase II occupancy at the CS/GH‐V promoter regions, presumably reflecting the looping of regulatory regions that was observed. Thus, insulin treatment of obese women with GDM results in overall CS/GH‐V RNA levels comparable to those seen in lean women. Recovery of the CS transcript levels, however, does not correlate with the preservation of the three dimensional chromosomal structure of the placental GH gene locus as defined in normal pregnancies. These data suggest a vulnerability of the hGH/CS gene locus chromatin structure and genes to excess caloric intake in pregnancy but also some plasticity in terms of response. Support or Funding Information Funded by the Canadian Institutes of Health Research

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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