Identification of potential PAR‐regulating proteinases in agricultural dust using an activity‐based serine proteinase probe
Notice bibliographique
Résumé
In previous work from our laboratories (PMIDs 26092994, 24152160, 21270400) we found that environmental allergens, including cockroach‐ and barn‐derived particulates, contain proteolytic enzymes that contribute to lung inflammation by cleaving and activating proteinase‐activated receptors (PARs). Preliminary work using in‐gel zymography demonstrated the presence of multiple serine proteinase inhibitor‐sensitive enzymes in hog barn dust extract (HDE: PMID 26092994). Because these HDE enzymes were blocked by alkylation of the active serine in many of the proteinases with PMSF and related agents, we reasoned that an activity‐based serine proteinase probe (ABP: PMID16554154) would also be able to alkylate the enzymes in the HDE. Using this novel approach (PMID 21270400), we ABP‐biotinylated the enzymes in HDE with ABPs selective for tryptic, chymotryptic, and elastase enzymes, respectively. Our data show differential reactivity of these ABP probes with enzymes in the HDE, identifying several enzymes in the mass range from 10 to 36 kDa, overlapping with the mass of ABP‐labeled porcine trypsin (28 kDa). Porcine trypsin itself is a major PAR‐regulating proteinase that is present in HDE, and this enzyme may play a prominent role in triggering lung inflammation in agricultural workers. Thus, HDE trypsin and other proteinases represent novel therapeutic targets both for preventing dust‐induced disease and for monitoring as environmental risk factors in many agricultural settings. Support or Funding Information Supported by the Canadian CIHR (MDH), The Lung Association of Alberta‐NWT (MDH), and NIOSH 2R01‐0H‐008539 (DJR)
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».